5 基因家族成员鉴定分析中,比如WORK基因:为什么要进行两次hmmer(一次WORKhmmer搜索,一次拟拟南芥hmmer搜索)搜索?意义是什么?还有就是第二次搜索出来的结果为什么还要手动检验一下?第二次搜出来的结果不就是有woKY结构域的才能被搜出来吗?(听了您基因家族分析的课,会操作点了,但不懂原理)

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omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

不了解WORK 基因家族,

最好的办法你看看别人文献中是否进行二次搜索,如果是你也做二次搜索就是了;

一般保守的家族只做一次搜索就可以,一些进化快差异大的家族会做二次搜索;

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  • sunny 提出于 2021-04-08 15:06

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