10 在运行VirusDetect_v1.7时报错

Can't locate object method "link_pattern" via package "Bio::Graphics::FeatureFile" at /root/perl5/lib/perl5/Bio/Graphics/Panel.pm line 1259.

[ERR IN CMD]: 

/root/VirusDetect_v1.7/bin/virus_identify.pl --reference /root/VirusDetect_v1.7/databases/vrl_plant --word-size 11 --exp-value 1e-05 --exp-valuex 0.01 --percent-identity 25 --cpu-num 8 --mis-penalty -3 --gap-cost -1 --gap-extension -1 --hsp-cover 0.75 --diff-ratio 0.25 --diff-contig-cover 0.5 --diff-contig-length 100 --coverage-cutoff 0.1 --depth-cutoff 5 --siRNA-percent 0.5 --novel-len-cutoff 100 /root/VirusDetect_v1.7/test_data_temp/test_data /root/VirusDetect_v1.7/test_data_temp/test_data.combined 

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

可能是perl包安装的有问题吧,

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  • 所得皆惊喜 提出于 2020-10-27 12:44

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