第一张图是geo直接下载的矩阵文件,是经校准的log数值,而在按照大讲堂标准化处理的课程,我标准化处理后形成的文件不是矩阵类型,而且每个基因的值是 “一串数字;个位数”的格式(如图二所示),请老师解释一下这种数值是什么意思,我应该如何转化成矩阵那样的数据呢?

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

你这个行名是芯片的探针ID,需要通过芯片的GPL信息转换成对应的基因ID,课程里面有讲的:GEO芯片数据挖掘 GEO芯片数据不同平台标准化 

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