5 请问有Bio-linux的安装软件及教程吗 biolinux


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omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

biolinux官方原版下载地址:http://environmentalomics.org/bio-linux/

biolinux软件安装可参考课程:linux系统使用

虽然原版biolinux已经包含了很多常用生物信息分析软件,但是,还有一些软件没有。因此,我们自行打包了一个biolinux的ova包,在根目录下的biosoft文件夹下我们自己安装了一些软件。方便进行《基因家族分析实操课程》分析。

我们打包的biolinux安装包,链接:https://pan.baidu.com/s/1ui9ndOsjbtgHrJoxxOcTMQ

系统用户及密码:

用户:manager
密码:manager
用户:root
密码:manager

biolinux的虚拟机安装见视频课程:《Linux生信分析环境搭建Bio-linux

组学大讲堂安装的软件列表,见安装目录  /biosoft:

annovar

annovar2016_06_24

BreakDancer

circos

e-PCR

GATK

java

meme

miniconda

MISA

Primer3

rpm

sratoolkit

vcftools


更多软件列表见:https://www.omicsclass.com/article/169



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