我下载的unmasked基因组和对应的GFF,GFF文件比基因组大的多,而且用TBtools提取的基因组序列,结果生成一个FA文件和一个FAI文件,提取的序列文件是空的。我想请教一下,这种情况应该怎么解决?

请先 登录 后评论

3 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

你的文件下载的有问题吧,确定是标准的GFF文件;

TBtools没用过提取序列文件,不太清楚;

请先 登录 后评论
Randongdong
我需要数据的物种,在NCBI上没有找到对应的GFF文件,在一篇论文里通过CoGo网址找到的,不知道可靠性有多大?
请先 登录 后评论
Randongdong
我需要数据的物种,在NCBI上没有找到对应的GFF文件,在一篇论文里通过CoGo网址找到的,不知道可靠性有多大?
请先 登录 后评论
  • 1 关注
  • 0 收藏,2471 浏览
  • 提出于 2020-06-12 17:23

相似问题