基因家族候选基因结构域鉴定 老师你好!做bhlh基因家族分析,对候选基因进行结构域鉴定是,同一个基因出现了一下情况,我要踢出该基因么? ps:pfam和文献中用的是HLH结构域来鉴定的

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2 个回答

生信老顽童

我不知道你的鉴定思路和方法是什么,如果学我们的课程,一般是先搜索pfam结构域,找到之后,使用结构域进行hmmer搜索,然后对搜索到的结果进行数据库确认,剔除那些没有结构域的基因,同时,每个基因保留一个转录本ID。

具体的可以学习我们的基因家族分析课程:https://study.163.com/course/introduction/1209048893.htm?share=1&shareId=1031484705

现在正好618,网易云课堂有活动。

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在路上
我是以拟南芥bhlh基因家族蛋白序列作为query,来比对目标物种相应数据库的蛋白质序列,从而过去候选基因
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  • 在路上 提出于 2020-06-09 09:54

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