参考这里：https://www.omicsclass.com/article/1939
5 利用ParaAT2.0生成计算KaKs所需要的AXT文件，但是AXT文件为空
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我想通过ParaAT2.0批量生成AXT文件，用于后续的Kaks_Calculator分析。在用ParaAT2.0时我发现生成的比对结果（AXT格式文件）都是空文件，里面没有序列比对结果。我又用软件里提供的例子文本运行了一遍，结果也是一样。请问这是为什么？
3 个回答
你好，我将Epal2nal.pl脚本导入环境变量，
echo 'export PATH=/home/manager/biosoft/ParaAT2.0/ParaAT2.0/Epal2nal.pl:$PATH' >>~/.bashrc
source ~/.bashrc
可还是出现sh: 1: Epal2nal.pl: not found，请问你是这样做的么？
问题解决了：ParaAT2.0中包含的一个脚本：Epal2nal.pl，这个脚本需要被加入环境变量里，否则会commands not found