基因的表达量和转录本的表达量

一个基因有多个转录本,请问基因的表达量和转录本的表达量之间的关系?基因表达量是所有转录本表达量之和还是平均数?

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1 个回答

omicsclass

基因的表达量是所有外显子上的reads的和,不是简单的把所有转录本表达量相加,基因为不同的转录本有相同的外显子;

也不是平均数;


可以参考一下HTseq计算read的方法:https://htseq.readthedocs.io/en/release_0.11.1/count.html#count

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