5 WGCNA分析中,灰色模块基因数若过多是说明划分模块有问题么?

我有100多个样品,选择5万左右的基因进行WGCNA分析,软阈值选择后符合R平方大于0.8,采用blockwise方法划分模块,但是最后发现有近一半的基因属于灰色模块。这正常么?能说明什么问题

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1 个回答

Daitoue
擅长:生命科学,生物信息

可以尝试对输入的5万多数据进行筛选 譬如方差、中位偏差值、均值等 选择top数据进行网络构建

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  • kuku93 提出于 2019-08-02 21:27

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