注释一般都是同源比对,相似的基因有相似的功能,咱们研究的基因如果比对到数据库某个基因就认为我们的基因也具有相同的功能;
所以不同的数据库收录的库序列不一样,注释会有差异也是正常的;建议取并集看看注释结果;
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一个gene 本身在不同的数据库中注释就会不一样,毕竟各数据库对应的注释信息不是同一类型,kegg pathway数据是涉及相关通路的注释信息,可能就是你这个gene没有对应的信息而已。如果不肯定结果你可以自己去kegg数据库进行注释试试。
可以参考一下:转录组标准分析后的数据挖掘