Sirius
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性别: 新疆 - 乌鲁木齐 注册于 2018-08-02

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7 个回答

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从NCBI下载了转录组数据,文件类型为文件,这类数据能不能分析

老师,这个课程已经下架了

回答于 2020-11-25 18:20

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求助mRNA ID 批量+1问题

老师,利用这个脚本修改,awk -F"[\t=]"  'BEGIN{OFS="\t"}{if($3=="mRNA"){print $1,$2,"gene",$4,$5,$6,$7,$8,$9"="$10 ; print $1,$2,$3,$4,$5,$6,$7,$8,$9"="$10"Parent="$10;}else{print $0}}' PO.gene.gff >PO.gene.gff1  可否提示一下这个脚本修改那一部分可以实现mRNAID后面批量加一个.1

回答于 2020-11-13 15:00

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MCSCANX共线性图代码报错

我的是family.ctl里面的染色体和基因组染色体的ID号不一样,报错Exception in thread "main" java.lang.NullPointerException at family_circle_plotter.paint(family_circle_plotter.java:197) at family_circle_plotter.main(family_circle_plotter.java:334) ,修改一致后,完美运行,希望能帮到同样问题的同学,也感...

回答于 2020-08-30 00:18

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利用gff文件提取基因结构,结果文件是空的

use Getopt::Long; my %opts; use Data::Dumper; GetOptions( \%opts, "in1=s", "in2=s", "out=s", "h" ); if (   !defined( $opts{in1} ) || !defined( $opts{in2} ) || !defined( $opts{out} ) || defined( $opts{h} ) ) { &USAGE; } open( IN1, "$opts{in1}" )  || die "open $opts{in1} failed\n"; ope...

回答于 2020-08-20 02:09

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氨基酸序列比对之后,gaps太多,mega一直出错,删除之后依然如此...

删除完gap,用最大自然法做进化树!

回答于 2019-01-13 22:18

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输入绘制circos图时出现错误

查看了,我重新下载了circos.pl脚本并存放在script文件下,但依然出现和上图一样的结果!

回答于 2019-01-06 18:33

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绘制转录本图,无法提取文件

谢谢老师!明白了!我整理完再提问!

回答于 2018-12-21 00:42