回答问题 · 2024-10-27 08:26 遗传图谱构建

回答问题 · 2024-10-25 09:23 老师，我的db文件夹里显示了所有染色体都已经导入，但是在将gvcf转换成vcf时，发现在Lc2Ns染色体就结束完成了，这是正常现象嘛，是我使用的近源种参考基因组的原因嘛？我的是简化基因组测序的

发表了文章 · 2024-10-24 12:05 igraph 报错： libglpk.so.36: cannot open shared object file: No such file or directory

回答问题 · 2024-10-22 14:06 成功得到了gvcf文件后，合并gvcf文件时，在导入db步骤中，由于gvcf文件超出了idx索引的处理范围，因此我使用CSI建立索引后，发现导入db的代码依旧无法运行，需要idx格式的索引，怎么办

回答问题 · 2024-10-22 09:48 linux里不能通过 sudo docker pull omicsclass/samtools:latest，显示连接超时

回答问题 · 2024-10-21 18:13 老师，您好，我在运行gatk的HaplotypeCaller时，因为样本过多（二三百个样本），运行成功的单个样本运行了24+个小时，尝试了采用ParaFly工具多任务并行，并且也尝试了同时运行多个nohup sh gatk.g.sh > gatk.g.sh

回答问题 · 2024-10-21 18:13 老师，我有141个样品，现在IndexFeatureFile，tabix，bcftools都无法成功构建gvcf的索引，只有CSI格式能成功索引，这个格式在后续也用不了，这个gvcf索引还有其他的解决办法嘛，还是说我只能重新生成vcf文件了

回答问题 · 2024-10-21 18:13 老师 就是质控出来的好多个个体的这个部分Per base sequence content都出现以下这种情况 这种是不是不行啊

回答问题 · 2024-10-21 16:56 fasttree 建树时没有找到这个软件

回答问题 · 2024-10-21 09:45 老师 就是我也买啦那个群体遗传的那个课程 我看啦一下 就是您课程上讲解的是下载参考基因组是拟南芥 我是做越峰杜鹃的 然后我重测序的也是 我的参考基因组是不是我自己组装出来越峰杜鹃的那个基因组啊 还是其他的呀 这里我没懂