回答问题 · 2025-03-13 18:29 在进行GWAS的LDBlock可视化中,在Win11本地的Docker执行LDBlockShow -Cutline 7 -InVCF $vcf -OutPut LD.p \ -Region Chr1:36000000-37000000 -Out
回答问题 · 2025-03-13 18:29 GWAS分析发现的问题如下:第一,过滤水稻vcf的RawData时(群体有176份),我选择的minGQ值为20(同时要移除InDel),结果得出过滤出来的SNPs数量不足1000,但是我查过一些资料,GQ值如果群体数量较少值不得小于20。请问遇到这种情况
回答问题 · 2025-03-12 17:11 老师,二代测序数据可以GWAS分析嘛?植物上做GWAS的话测序深度5X可以嘛?
回答问题 · 2025-03-11 17:57 合并GVCF文件
回答问题 · 2025-03-07 15:37 泛基因家族,典型基因和非典型基因的热图怎么做?
发表了文章 · 2025-03-06 16:01 已知集合交集数量绘制韦恩图
回答问题 · 2025-03-05 10:57 老师,我有两个分级性状,需要进行BLUP嘛
回答问题 · 2025-03-05 10:57 老师,我的结构变异文件是5个梨品种,转录组数据中与sv相同的品系,只有3个,这个影响吗?
回答问题 · 2025-03-04 09:54 老师,我在构建泛基因列表时,做cat pangene_filter.*lifted.anchors | grep -v "^#" | awk '{print $1"\t"$2}'> ../03.jcvi-pan-vs-genome/syn.txt这一步,找
回答问题 · 2025-03-03 17:18 老师您好,分析SNP和INDEL时报错,请解答。