老师您好,我做比较基因组时,orthofinder2运行时出现报错,这是什么原因?该如何解决。请老师解答


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1 个回答

Ti Amo

索引大于或小于列表的有效范围。
1. 确认输入fa文件没有任何空行
2. 物种名称规范​​,每个文件名代表一个物种,且文件名中​​不能包含特殊字符(如空格、括号、逗号等)
3. 如果输入数据较大,减少线程数(-t)或增加内存
4. 如果问题集中在某个特定文件,尝试逐步排除,逐个物种运行测试
5. 如果不能定位是在哪一步出现的问题,可以尝试分步运行OrthoFinder

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  • CHENjh 提出于 2025-08-09 10:59

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