老师,我正在泛基因家族分析中结构变异基因注释最后一步,#从结构变异注释文件中提取WRKY基因结构变异信息
grep -f ${ref}_gene_without_lable.list All.variant_function > All.final.sv.out
我拿到的vcf是我研究的基因家族的vcf文件,按理说我拿到的All.variant_function(434行)已经是这个基因家族的结构变异信息吧?是不是不需要做最后一步,然后我按照老师的步骤,做了最后一步,得到的All.final.sv.out只有214行?有问题吗?

