rzx 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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MCScanX这一步做完分析后发现了问题

WRKY.tandem文件是从第八步复制过来的。如果本身是空的证明该基因家族没有串联重复基因对。另一个文件是那一步的？可能是本身没有结果

回答于 2024-09-23 15:30

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如果想对基因ID进行重命名。需要将基因结构图用到的所有文件的基因ID进行修改。检查一下所有输入文件有没有修改，对应上。

回答于 2024-09-12 17:05

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想调整A\B枝的位置，单击分支处，在弹出面板上选择“Rotate children”即可

回答于 2024-09-12 11:10

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修改gff文件，或者在Ai中修改图片，都可以修改了基因名称

回答于 2024-09-12 11:00

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课程是从代谢物表达量开始分析的。原始数据.raw需要经过搜库分析，可以根据质谱仪选择合适的搜库软件去进行搜库分析，才能得到表达量矩阵文件。

回答于 2024-09-12 09:41

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检查一下layout文件格式有没有问题，参考笔记:https://www.omicsclass.com/article/571

回答于 2024-09-11 11:17

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可能是存储不够了吧，你把用不上的文件在本地备份然后在服务器上删掉，尝试一下

回答于 2024-09-09 11:52

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截图里面的id没有重复。是同一个基因序列上鉴定出2个基因家族结构域：-1；-2；

回答于 2024-09-06 18:01

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也有可能是序列有问题。运行的命令是什么？你可以先挑一两条序列跟拟南芥序列合并跑一下进化树，看是哪里的问题。

回答于 2024-09-06 11:40

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根据多序列比对图，将对应的字母放到对应的位置。也就是，你看其他基因在序列那个位置上有WRKYGQK，就把这个基因上的WRKYGQK放到对应位置。不是简单的对结构域中间横杠去掉。同时保证所有比对序列长度一致，缺失位置都用-填充

回答于 2024-08-30 18:24