omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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基因家族分析时，提取cds与pep序列报错

提示文件路径不对，你检查变量对应的文件路径是否正确

回答于 2023-11-17 07:09

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对的，服务器出于安全考虑长时间不与服务器命令，自动断开：如果是putty链接服务器可以设置一下这个地方：

回答于 2023-11-16 13:31

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有群体结构可以用 PCA等数据矫正，也可以做GWAS分析的；

回答于 2023-11-16 13:05

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我们的共享服务器上有docker镜像的本地版本存放路径：/share/docker_images 你可以用下面的命令导入即可，不用在线下载，在线下载有可能由于网络原因导致报错： docker load -i /share/docker_images/reseq-v2.0.tar.gz

回答于 2023-11-16 11:35

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建议分开用hmmer搜索，再根据基因家族特点取交集或者并集

回答于 2023-11-16 11:29

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你下载的基因组版本不一致，你和公司的基因组版本保持一致才行

回答于 2023-11-15 17:06

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代码和镜像更新了，你需要重新下载代码和对应的镜像：https://www.omicsclass.com/article/2286

回答于 2023-11-15 17:05

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对的，建议分开运行，

回答于 2023-11-15 17:03

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每运行一步检查一下输入输出文件，看看有没有异常，有异常的脚本单独提问，你这个可能是GFF文件格式出错了；

回答于 2023-11-15 17:02

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降低gsl的版本：devtools::install_version("gsl", version = "1.9-10")

回答于 2023-11-14 23:04