family.ctl:这是拟南芥的染色体编号,你换成你的基因组染色体编号就可以了; 保存一下; 同样:gene_family.txt,里面的是拟南芥的某个基因家族的基因ID列表,你换成你要研究的某物种某基因家族的基因ID列表,就可以; 我课上用的都是拟南芥的额,你把所有的文件都换成自己的,不就是研究自己的基因组,以及自己研究的...
回答于 2018-10-30 09:34
目前我知道的,figtree中的bootstrap数字只能是小数;建议将进化树导出pdf用Adobe illustrator修改成整数。 美化编辑进化树建议使用evolview:https://www.omicsclass.com/article/671
回答于 2018-10-30 09:28
可以下载最新版本的TBtools:https://github.com/CJ-Chen/TBtools 使用方法:https://www.omicsclass.com/article/382 换个显示效果试试:
回答于 2018-10-29 17:42
可到virtualbox 官方网站下载:https://www.virtualbox.org/ 是一个软件,你安装一下就可以,其他文件不需要;
回答于 2018-10-28 12:24
应该是序列差异太大,可以删除一些大的gap,或者删除一些差异大的基因: https://www.omicsclass.com/article/221 如果基因全长序列差异太大,建议截取结构域所在序列构建进化树; 如果要编辑MEGA输出的多序列比对结果建议用genedoc:https://www.omicsclass.com/article/502
回答于 2018-10-27 07:15