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老师,我想问一下,第一列的1234这种数字代表的是啥呀?我能不能...

GFF文件吗?第一列是染色体ID,不是随便加的,要根据物种基因组染色体编号

回答于 2024-07-15 15:44

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执行### 物种注释 16S/18S #全长作为分类数据库 ### 反复跳出do...

电脑内存不够自动杀死任务了,你看看这个:https://www.omicsclass.com/article/1413 长时间运行的任务,建议电脑不要关机;使用以下命令后台执行命令: nohup sh qiime2.sh > qiime2.sh.o &

回答于 2024-07-15 15:42

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进入容器以后是这个样子,怎么办

ctrl+c 终止容器里面的任务,试试的

回答于 2024-07-15 15:41

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summarize_taxa.py缺少脚本

这个脚本时qiime1的脚本,安装在我们提供的docker镜像中,你在docker容器里面可以直接使用; 不然你需要自行安装qiime1到你的电脑中;

回答于 2024-07-11 18:31

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docker拉取不了镜像了?怎么回事

dockerhub 国内上不了,有购买我们课程可以联系客服处理:点击联系客服

回答于 2024-07-11 18:29

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猪单细胞测序数据拟时序分析时已知细胞分化起源,怎么修改代码?

使用 5版本的镜像,可以运行monocle2:single-cell-v5.0.tar.gz  并且已经更新绘制热图; 代码已经更新,需要重新下载:https://bdtcd.xetlk.com/s/4i88K6

回答于 2024-07-10 09:12

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asv分类报错

建议用我们提供的docker镜像分析数据,避免软件环境不同导致报错; 你这个可能是qiime2安装的版本问题,qiime2版本不同可能导致出错;

回答于 2024-07-09 09:17

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Failed to create bus connection: No such file or directory

这个是docker镜像里面的正常报错,不影响脚本运行可以忽略:Failed to create bus connection: No such file or directory 不知道你运行的是哪个脚本,我们课程很多,建议你把命令行贴出来,输入输出文件都截图贴一下才好给你排查错误;

回答于 2024-07-09 09:15

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bandage中节点的深度

你的30X测序只是平均测序深度,实际测序并不均匀,一般基因组上有重复区域重复越多深度会很高;

回答于 2024-07-09 09:13

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在学习泛基因家族docker的tar -zxvf时出现错误,根据步骤做的,...

链接文件路径写错了,你重新链接一下,应该是data吧,你写成date了;

回答于 2024-07-09 09:12