omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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请问，TCGA数据库中下载的数据如何区分癌组织和癌旁呢？

可根据样品编号区分不同的类型，具体见：https://www.omicsclass.com/article/439

回答于 2019-03-03 17:59

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简单，查阅文献就行。没有找到相关文献就是别人没做；

回答于 2019-03-03 17:55

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没测试过蛋白序列，应该是不行，你用cds吧；

回答于 2019-02-28 20:36

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可以用evolview美化编辑进化树可解决这个问题，功能更强大：https://www.omicsclass.com/article/671

回答于 2019-02-28 17:32

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没用过这个软件，不好回答

回答于 2019-02-27 23:42

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人里面很少做基因家族分析，因为分析都很透彻了；

回答于 2019-02-27 23:42

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不知道你说的是哪一步操作，可贴图说明；关于阈值的选取，可以参考文献解读：基因家族文献思路解读

回答于 2019-02-27 23:41

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看不到文件内容，不好找原因。可以报四个输入文件bed cds ，都head一下截图贴上；重新更新一下问题；

回答于 2019-02-27 23:38

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程序没有出错，读取的是以下ID，你截图的部分gffread不会读取：尽量不要在NCBI上下载基因组注释信息，后期不好处理；

回答于 2019-02-24 09:24

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这个虚拟机启动的时候提示信息，看看点确认就行；

回答于 2019-02-24 09:20