omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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老师我用这个脚本文件提取基因的注释信息，为什么只能提取出CDS...

默认是提前CDS的，与UTR信息的，与外显子信息差不多；

回答于 2020-03-16 15:17

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检查最后的输入文件是否有问题，建议重新下载；检查hmm文件是否在当前目录下：WRKY.hmm

回答于 2020-03-16 15:16

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hmm通过结构域搜索，会更精确； blast同源比对，精确度差些，假阳性多；

回答于 2020-03-16 14:47

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不可以，你弄清楚Un序列是怎么来的？还有共线性和大片段复制分析原理就知道是的，Un上的序列只能用同源序列。

回答于 2020-03-16 11:57

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重新检查你分析的数据是否有错误. 绘图参考：https://www.omicsclass.com/article/382

回答于 2020-03-15 08:28

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看看这个把TCGAbiolinks包更新到最新：https://www.omicsclass.com/question/2181

回答于 2020-03-15 08:25

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没用过这种下载数据的方法，你试试其他的方法吧

回答于 2020-03-14 09:26

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与课程示例文件对比一下。文本编辑建议用notepad++专业的文本编辑软件，不要用记事本，避免不必要的错误；

回答于 2020-03-13 17:21

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文章的分析内容越多当然越好发文章了，所以结合起来好

回答于 2020-03-13 17:12

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输入文件都要截图，你截图的GFF都是无用的信息；重新更新问题吧；我猜测你的额GFF文件里面的MRNAID与提供的ID 列表里面的ID不一致，你在看看GFF文件吧；

回答于 2020-03-13 17:11