omicsgene
omicsgene - 生物信息
实名认证 专业认证

性别: 北京 - 北京市 注册于 2018-04-20

擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

生物信息

向TA求助
14320金币数
80980 经验值
444个粉丝
主页被访问 86539 次

4092 个回答

0 赞同

有关MCscanX共线性分析时一些冷门物种(芦笋,NCBI下载的文件)...

没必要,基因组有多少就是多少

回答于 2020-08-11 09:49

0 赞同

请问一下在做mcscan分析的时候pep.fa文件里只有3w多条蛋白序列,...

不知道你怎么统计的,你看看文件结果说明:https://www.omicsclass.com/article/756

回答于 2020-08-11 09:48

1 赞同

老师你好!构建进化树的时候,需要把目标基因家族的基因进行亚族...

没仔细看你的文献,只能推测是因为拟南芥的基因研究比较透彻分类明确,其他物种的基因和拟南芥的基因在同一个大的分支中,就可以认为其他物种的基因也和拟南芥基因相同的分类;

回答于 2020-08-11 09:45

0 赞同

有关MCscanX共线性分析时一些冷门物种(芦笋,NCBI下载的文件)...

基因组中一个基因有几个转录本就是几个,一般不用自己去分析不同的转录本

回答于 2020-08-11 09:43

0 赞同

老师您好!我把顺势作用元件的名称都改成了大写的,但是出现了如...

这个链接打不开也没关系已经说过改哪个了:https://www.omicsclass.com/question/3141 还有,你确定你要显示这么多顺势作用元件吗?  不会改的话等我们更新镜像的;

回答于 2020-08-10 16:59

0 赞同

更改文件或者perl脚本后get_gene_weizhi.pl依旧提取文本为空。

你要把gene:删除,之后把脚本里面的gene:也删除 

回答于 2020-08-10 13:04

1 赞同

睡神15分钟前 你解决了吗?我也遇到了这种情况,单个基因能显示...

请检查你的feature bed文件中的顺势作用元件的名称,是否存在相同的结构域名称存在大小写差异问题,请统一成一样的名字: 例如以下应该统一成MYC,不然会出错; 这是因为我们的分析的目录在winddows中,文件目录是不区分大小写的;

回答于 2020-08-09 10:58

0 赞同

docker-GSDS网站出错:Request-URI Too Long The requested URL'...

由于apache的限制可添加: add a new line (LimitRequestLine 10000) under AccessFileName .htaccess.  文件地址:/etc/apache2/apache2.conf 具体参考:https://stackoverflow.com/questions/2891574/how-do-i-resolve-a-http-414-request-uri-too-long-error 最后重启 apache :/etc/init.d/apache2 restart

回答于 2020-08-09 10:52

0 赞同

在GDC数据库下载数据出错

把下载的方法改成method="api" 试一下; 或者换个网速快的网络环境;

回答于 2020-08-09 08:27

0 赞同

老师您好!

把下载的方法改成method="api" 试一下; 或者换个网速快的网络环境;https://www.omicsclass.com/article/1060

回答于 2020-08-09 08:27