omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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gdcRNADownload(project.id = 'TCGA-CHOL', +...

没用过这个包，你看看TCGAbiolinks包下载：https://www.omicsclass.com/article/1060

回答于 2020-10-31 08:03

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看看这个:https://www.omicsclass.com/question/2399

回答于 2020-10-30 10:35

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不清楚你的问题是什么，没明白你的问题

回答于 2020-10-29 13:09

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DEseq2是针对高通量测序的表达分析做差异分析，芯片数据建议用limma包做差异分析；

回答于 2020-10-29 13:08

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把GFF中的gene： CDS： transcripts：删除试试：

回答于 2020-10-29 13:07

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有灰色部分，只是少了些；你再看看；

回答于 2020-10-29 13:05

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blast比对需要运行很长时间，不要中断了，检查一下；我看你的文件没问题，如果都没有问题可能是物种差异太大没有结果；你可以再找找近缘的物种试试。

回答于 2020-10-27 21:22

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可能是perl包安装的有问题吧，

回答于 2020-10-27 21:20

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需要看看你的GTF文件格式是否有异常；可以把GTF文件发给我看看；

回答于 2020-10-26 21:04

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再看看前面的mcscanX那节课程里面生成的；

回答于 2020-10-26 21:03