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擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

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在您的课程《基因组重测序数据分析实操课程》中:变异结果注释AN...

有些参考基因组里面有一些 ambiguous 碱基 ,ANNOVAR处理不了,这是作者的回答:https://annovar.openbioinformatics.org/en/latest/misc/faq/  解决办法就是将  ambiguous 碱基根据IUPAC :(https://www.omicsclass.com/article/409 )编码替换成一单个碱基;

回答于 2021-09-27 09:48

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老师您好,在您的课程《基因组重测序数据分析实操课程》中:变异...

有些参考基因组里面有一些 ambiguous 碱基(杂合碱基) ,ANNOVAR处理不了,这是作者的回答:https://annovar.openbioinformatics.org/en/latest/misc/faq/  解决办法就是将  ambiguous 碱基根据IUPAC :(https://www.omicsclass.com/article/409 )编码替换成一单个碱基;

回答于 2021-09-27 09:47

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老师您好! 我们之前购买了基于biolinux的基因家族分析课程,还...

不用重新购买,直接观看即可:https://bdtcd.xetslk.com/s/1BAqPp

回答于 2021-09-26 12:47

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代码报错

metadata的第一列数据和 表达量文件里面的列名有问题, metadata中有样本不在 表达量文件中,你检查一下;

回答于 2021-09-26 10:09

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老师您好,我利用Fst、π和Tajima's D方法对2个种群的重测序数据...

看看这个吧,tajimaD 可以判断负选择:https://www.omicsclass.com/article/1337

回答于 2021-09-26 10:07

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老师您好,我利用Fst、π和Tajima's D方法对2个种群的重测序数据...

看看这个吧,tajimaD 可以判断负选择:https://www.omicsclass.com/article/1337

回答于 2021-09-26 10:07

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代码报错

可能是你的数据有问题吧,用下这段代码试试: ################################################### #从芯片的原始数据获得表达数据 ################################################### GSE <-"GSE100935" files = list.files("D:/data", pattern = "GSM") files AffyBatch=ReadAffy(filenames=files) n.Samp...

回答于 2021-09-24 18:10

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老师你好,请问如何结合转录组数据分析某基因家族的表达量 我有...

可以利用家族基因表达量绘制热图:https://bdtcd.xetslk.com/s/1BAqPp

回答于 2021-09-24 18:03

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老师问一下,我现在准备好了我的物种WRKY 蛋白的全长序列和拟南...

基因家族分析课程里面有脚本可以根据hmmer搜索的结构截取结构域所在的序列:https://bdtcd.xetslk.com/s/1BAqPp

回答于 2021-09-24 17:59

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进行hisat比对后,summary文件里出现图片中内容,提醒了错如何解...

命令行错误:这里的空白不要有:

回答于 2021-09-24 11:03