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擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

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lasso cox 进一步筛选预后基因(排除共线性),简化模型

看不到你的命令行, 检查你命令行里面 指定的 基因ID, TIME  EVENT 在你的输入文件中;

回答于 2021-11-16 10:34

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在构建进化树的时候,通过比对基因家族的蛋白序列发现保守区很少...

序列全长差异大,可以使用保守的结构域所在的序列构建进化树;

回答于 2021-11-15 10:04

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老师,问一下,ncbi中没有基(因组注释文件(GFF),只有GENEBAN...

不建议用NCBI上的GFF文件,里面的文件不标准;你换个地方下载基因组吧; GBFF文件是可以转换成GFF文件的,但是比较麻烦;

回答于 2021-11-15 10:03

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老师,我想问一下,我的E值有好多是0,这怎么筛选啊!

E值越小说明结果越可靠;一般我们筛选小于某个E值;0表示最小的E值非常好的结果不用筛选;

回答于 2021-11-15 10:01

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请问,首次使用MCscan (Python version)可视化作图时,没有mcsca...

课程里面有这两个文件的例子,你复制过来,手动修改里面的内容为自己物种的信息即可: 基因家族课程里面已经有介绍:https://bdtcd.xetslk.com/s/1BAqPp 建议使用我们课程里面的docker镜像,你这个系统的mcscan安装有问题;

回答于 2021-11-15 09:59

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为何我研究的物种设计snp引物时,输出引物文件的excel是空的

最近更新了重测序镜像, 你可以重新下载这个镜像试试:docker pull omicsclass/reseq:v1.2

回答于 2021-11-15 09:56

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对齐的序列必须是相等的长度?

看看这个问题:https://www.omicsclass.com/question/4252

回答于 2021-11-15 09:55

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您好,我在做KEGG图的时候遇到这样的问题,改如何解决呢,谢谢!

下载的进行版本是哪个版本? 你下载这个版本试试:docker pull omicsclass/rnaseq:v1.1

回答于 2021-11-15 09:54

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老师您好,mega总是显示对齐的序列必须是相等的长度是什么原因

用序列做进化树吗? 做进化树之前需要做多序列比对,之后才可以做进化树

回答于 2021-11-15 09:52

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我想问一下公司的cleandata怎么导入到qiime2里面去,原始数据我...

合并后的clean tags 导入qiime2: manifest.txt文件准备: sample-id       absolute-filepathC2      /share/nas1/DATA/C2.fastqC1      /share/nas1/DATA/C1.fastq 导入命令: qiime tools import   --type 'SampleData[SequencesWithQuality]' --input-path manifest.txt  --output-path demux_joined_filt.qza --in...

回答于 2021-11-12 16:53