omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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老师你好，我换了一台32g的电脑，并且启动时给分配了16g的内存，...

你没换电脑吧，我记得这图还是原来的图

回答于 2022-01-15 15:50

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可以用bin的文件绘制，线会平滑些；做LD分析，不要过滤LD，多保留些SNP

回答于 2022-01-14 11:32

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都是 top 可能有问题吧

回答于 2022-01-14 11:30

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你的docker没有安装成功，再看看课程吧：https://bdtcd.xetslk.com/s/3Rcvt0

回答于 2022-01-13 09:13

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外群也测序一下，放在一起构建进化树

回答于 2022-01-13 09:12

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可以看看这个问题: https://www.omicsclass.com/question/3975 怀疑是内存不够，你找个内存高的电脑试试的，至少20G以上的吧；或者把这两个文件的内容贴一下我看看:

回答于 2022-01-11 16:43

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你的vcf数据有问题，窗口里面都没有SNP：

回答于 2022-01-11 09:29

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fst和Pi滑窗用的窗口和步长要统一,不然脚本无法合并相同的窗口进行汇总绘图:

回答于 2022-01-10 14:34

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可能前面的变量没有设置：你运行一下： echo $step echo $window 看看有么有值输出，检查变量设置问题；建议不要用记事本编辑文件，可能出现linux和windows编码问题导致错误，用notepad++

回答于 2022-01-10 12:38

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两个文件的染色体编号不统一，你需要统一一下；

回答于 2022-01-10 10:00