omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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老师您好，我想问一下小麦扫描的90K芯片数据进行GWAS分析，在GWA...

芯片的数据也可以生成VCF文件，因此不需要fastq文件，你做的芯片数据，让公司直接给你变异结果SNP文件即可，最好以VCF文件格式给你，这样你就可以直接用于GWAS或者群体遗传进化分析

回答于 2022-03-07 11:32

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查看一下对应的行格式是否有问题，可能是上一般hmp文件生成有问题，你重新生成一下这个文件

回答于 2022-03-07 11:30

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根据自己的需要提取，

回答于 2022-03-07 11:28

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windows安装docker可以看这里：https://www.omicsclass.com/article/1198 linux安装docker看这里 : https://www.omicsclass.com/article/1181

回答于 2022-03-02 16:47

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https://guangchuangyu.github.io/2016/03/yet-an-unofficial-bioedit-for-osx/ 安装视频：https://www.youtube.com/watch?v=MI9ScGgGvtU

回答于 2022-03-02 16:40

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这里写的不是很清楚吗？https://www.omicsclass.com/article/1303 你新建一个文本文件，文件名字叫：containers.cmd 然后把贴博文里面的内容粘贴进去，运行一下；实在不行就重新安装一个专业版本的win10，避免麻烦；

回答于 2022-03-01 17:27

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看看这个:https://www.omicsclass.com/question/4474 改名字没关系的

回答于 2022-03-01 14:48

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什么系统版本？如果是win10家庭版本的可以安装这个： https://www.omicsclass.com/article/1243 注意不要安装最新的docker，安装博文里面指定的版本安装，安装之后不要更新docker

回答于 2022-03-01 11:30

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WRKY.hmm 文件打开看一下，文件内容有问题；

回答于 2022-03-01 11:26

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perl的解释器是不是没有安装和设置好； https://www.perl.org/

回答于 2022-02-28 11:56