建议用我们的docker镜像里面的qtlseq经过修改,兼容vcf文件; 自己安装的,可能vcf格式问题导致错误,你再看看作者的帮助文档吧
回答于 2023-06-16 18:03
有的软件 会根据自己运行过程中的需要自动选择使用线程数量,100 只是设置最大线程,软件不一定一直都使用这么多线程; 你再观察观察吧
回答于 2023-06-14 16:51
scripts/ParaAT/Epal2nal.pl 这个文件需要加可执行权限; chmod a+x scripts/ParaAT/Epal2nal.pl
回答于 2023-06-14 16:50
可能那些长的contig 就是一条染色体吧,你看看其他长的contig是不是这样的;
回答于 2023-06-01 14:33
1. 我们的deep TE用的是自带的库预测分类,方法不一样; 2. 第99行和第204行的区别:运行RepeatMasker结果文件的不同第99行:生成的contig.fa.masked文件,其中的重复序列是用N表示 参数不一样,xsmall 表示小写ATCG为repeat soft mask第204行:同样生成contig,fa.masked,其中的重复序列用小写字母表示。两者不同,...
回答于 2023-05-28 15:45
-f 参数 是过滤短于这个参数的染色体,你的基因组染色体长度你看看的,有这么长吗?
回答于 2023-05-28 15:37
样本ID不能超过10个字符,你仔细检查一下,简化自己的样本ID; 如果超过10个字符会自动截断到10个字符,可能导致ID重复,你打开phy文件看看吧
回答于 2023-05-27 12:59