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我的fasta文件是由scaffold组成的，不是直接的A01和C01之类的，...
我不是解答过了吗：https://www.omicsclass.com/question/7893
回答于 2025-05-21 15:36
Rscript $scriptdir/gwas_manhattan_plot.r -i pvalue_$m.txt -F...
你这是有多少条染色体啊？600多条？你再确认一下。 如果你确认了没有问题的话，你就用这个参数后面加上7个十六进制代码的颜色，像这样--pallete "#4abb6b" "#f28d21"...，我这里省略了，给你举例了两个，你需要在后面补上5个
回答于 2025-05-15 17:52
Rscript $scriptdir/gapit_gwas.r -i /work/hapmap.txt.gz -t /...
没有报错先不用管，先让他跑一下，等报错了，或者跑出来没有结果再说，像这种很长的任务可以投递到后台执行： nohup 你的任务 &
回答于 2025-05-15 09:14
perl $scriptdir/vcf2hmp.pl all_clean.vcf.gz hapmap.txt.gz始...
你怎么知道你的变量设置成功了？你打印一下看看 echo $scriptdir
回答于 2025-05-13 13:50
bash:docker:command not found是什么情况，还有就是根据我这个...
同学，你现在这个状态就是已经在创建的容器里了，你能看到吗，你现在是root权限，在容器里的话是不能执行docker指令的，想退出按键盘上的ctrl+p+q 而且你这个路径明显是不对的，"/"根路径下面是没有你自己的家目录的，不会有/~这种路径的，你如果不知道自己亚挂载的目录的路径，直接进入到你要挂载的目录里面，然后执行pwd...
回答于 2025-05-13 09:20
后台运行
你的shell脚本是不是在windos编辑器里面编辑的，应该是混入windos字符了，换行符一类的，下次直接在linux里面编辑，你试一下dos2unix 2.sh
回答于 2025-05-12 09:12
从结构变异注释文件中提取WRKY基因结构变异信息
同学，我没有分析你的数据哈，具体情况我不是很清楚，你是自己跑的结构变异注释吗？如果你只用了一个参考基因组构建的注释信息库，你需要通过最后一步把对应家族编号的基因（在参考基因组中）提取出来。如果你是直接从作者那里获取到的结构变异注释结果，可能你需要问问作者相关的信息
回答于 2025-04-27 09:11