我用命令python3 /work/script/ibd_pop.py -lr /work/data/listR -la /work/data/listA -lb /work/data/listB -i ../01.chr_ibd/sativa.ibd 计算IBD 的时候,没有报错,出来的文件都是空文件。路径是,root@09bd06585807 14:52:51 /work/my_ibd/02.pop_ibd。 有时间帮我看看。
你把你输入文件截图发出来看下
我们的代码都是测试通过的,大部分报错都是文件格式问题,你仔细核对自己的数据和示例数据差别,确保列分隔符是tab键;
windows里面记事本编辑过的文件很容易报错, 一定要注意编码格式,建议用notepad++等文本编辑工具编辑:https://www.omicsclass.com/article/395
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