宏病毒组分析一区

宏病毒组分析一区

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2023-09-07 09:28
  • 阅读 ( 1315 )

kraken2生成的biom文件处理

使用kraken2软件做宏基因组或扩增子项目物种注释项目的时候,如果后续不使用bracken则可能会遇到一个问题,结果生成的biom文件中taxonomy并不是最终结果,比如下面这样 可以用脚本来处理,删...

  • 0
  • 0
  • xun
  • 发布于 2023-05-31 17:33
  • 阅读 ( 2041 )

组学大讲堂QIIME2(v1.5)镜像更新说明

对于qiiem2更新细节的一些描述

  • 0
  • 0
  • xun
  • 发布于 2023-01-06 13:26
  • 阅读 ( 3469 )

qiime2 安装-使用国内镜像避免网络原因报错:

qiime2 安装-使用国内镜像避免网络原因报错:

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2022-10-29 10:07
  • 阅读 ( 3416 )

微生物多样性分类柱状图按照分组进行排序脚本升级;tax_bar_plot.r

微生物多样性分类柱状图按照分组进行排序脚本升级;tax_bar_plot.r

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2022-07-27 11:11
  • 阅读 ( 2278 )

IF=5|干眼症微生物多样性分析案例解析

IF=5|干眼症微生物多样性分析案例解析

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2022-02-14 13:07
  • 阅读 ( 2439 )

qiime2 18S 分类器构建

qiime2 18S 分类器构建

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2021-08-06 10:32
  • 阅读 ( 3790 )

环境因子分析

环境因子分析

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2021-02-26 15:28
  • 阅读 ( 11681 )

扩增子16S/ITS/18S微生物多样性课程更新-机器学习随机森林分析

扩增子16S/ITS/18S微生物多样性课程更新-机器学习随机森林分析

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2021-02-24 11:57
  • 阅读 ( 3525 )

qiime2 couldn't connect to display "localhost:12.0"

qiime2 couldn't connect to display "localhost:12.0"

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2021-01-04 15:29
  • 阅读 ( 5129 )

利用qiime2对微生物扩增子测序数据文库根据barcode信息拆分数据

Demultiplexing and Trimming Adapters from Reads with q2-cutadapt

  • 1
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2020-12-23 11:09
  • 阅读 ( 9437 )

机器学习文章套路-预测土壤枯萎病-ISME IF=9

机器学习文章套路-预测土壤枯萎病-ISME IF=9

  • 1
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2020-12-18 20:06
  • 阅读 ( 3724 )

bugbase指定表型预测

Bugbase除了生成默认九种表型的预测文件,在本地运行还可以指定表型对样品进行预测

  • 0
  • 0
  • Morii
  • 发布于 2020-12-14 12:00
  • 阅读 ( 4464 )

环境微生物领域杂志影响因子

环境微生物领域杂志影响因子

  • 1
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2020-11-13 13:22
  • 阅读 ( 3013 )

人工智能(AI)在微生物组中的应用-随机森林分类与回归预测

机器学习-随机森林微生物中的应用-分类与预测

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2020-11-10 14:17
  • 阅读 ( 8452 )

qiime2自己建立分类器 greengene

自己建立分类器

  • 1
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2020-11-06 10:26
  • 阅读 ( 6982 )

vif.cca 筛选环境变量:VIF是非常有用的指示符,表明数据集中存在多重共线性。 它不能很好地指示应从模型中删除哪个预测变量。

VIF是非常有用的指示符,表明数据集中存在多重共线性。 它不能很好地指示应从模型中删除哪个预测变量。

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2020-11-05 14:44
  • 阅读 ( 5829 )

16S聚类还是降噪?

16S聚类还是降噪?

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2020-11-02 20:59
  • 阅读 ( 6038 )

安装picrust2 保存:pkg_resources.DistributionNotFound: The 'cython' distribution was not found and is required by biom-format

安装picrust2 保存:pkg_resources.DistributionNotFound: The 'cython' distribution was not found and is required by biom-format

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2020-10-28 07:15
  • 阅读 ( 4382 )

qiime1 matplotlab绘图报错解决:_tkinter.TclError: no display name and no $DISPLAY environment variable

qiime1 matplotlab绘图报错解决:_tkinter.TclError: no display name and no $DISPLAY environment variable

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2020-10-19 14:55
  • 阅读 ( 3395 )