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IF=4.3 | 衰老水稻种子的转录组代谢组联合分析

IF=4.3 | 衰老水稻种子的转录组代谢组联合分析

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  • 安生水
  • 发布于 2025-05-30 17:41
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IF=11.8| 钟花樱的端粒到端粒基因组揭示了樱花亚属的基因组进化

2025年2月 GigaScience杂志发表了一篇题为“The telomere-to-telomere genome of flowering cherry (Prunus campanulata) reveals genomic evolution of the subgenus Cerasus”的基因组组装文章...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2025-05-30 17:35
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IF5=7.8 |骆驼蓬属(Peganum)染色体水平基因组组装与群体遗传进化分析

中国科学院西北高原生物所在《Molecular Ecology Resources》期刊发表最新研究论文，文章通过组装染色体水平物种基因组，群体重测序等分析，首次揭开了骆驼蓬属物种的起源、分化历史及适应性进化机制，并提出创新性的“混合-隔离-再混合 ”（MIM）循环模型

IF=13.8 | 饮食调节山羊肠道微生物的纤维素利用效率

解析膳食调控在山羊胃肠道对纤维素降解利用效率的影响

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  • xun
  • 发布于 2025-05-30 16:40
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IF=4.1|玉米ARF基因家族的泛基因组分析和表达验证

“ 2025年2月Frontiers in plant science 杂志发表了一篇题为“ Pan-genome analysis and expression verification of the maize ARF gene family”的泛基因家族文章。” 本研究基于玉米泛基因组...

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  • rzx
  • 发布于 2025-05-29 10:50
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空间转录组细胞共定位分析结果解读 MISTy分析

空间细胞共定位分析结果解读 MISTy分析

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  • omicsgene
  • 发布于 2025-05-26 18:11
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Linux系统删除/share分区合并到/home

Linux系统删除/share分区合并到/home

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  • 安生水
  • 发布于 2025-05-14 18:45
  • 阅读 ( 364 )

deepseek绘图之--FPKM小提琴图

deepseek绘图之--FPKM小提琴图

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  • 安生水
  • 发布于 2025-05-14 09:24
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植物单细胞转录组文章

单细胞转录组文章

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  • omicsgene
  • 发布于 2025-05-13 10:31
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PASA 记录

PASA是我们进行基因结构预测的时候常用的软件，其最早是开发用于拟南芥的基因结构注释，目前在动植物的注释中被广泛应用。

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  • Ti Amo
  • 发布于 2025-05-09 10:08
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python代码到pubmed上搜索关键字，统计每年发文章数量

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  • omicsgene
  • 发布于 2025-05-07 17:52
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共线性分析绘图报错

获取的基因对应的蛋白序列信息是通过文件互传上传的，文件与视频教学少了个后缀是.tandem的文件。绘图时候出现报错是哪里的问题？

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  • Wfghsfd
  • 发布于 2025-05-02 21:30
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Treemix 软件：群体基因交流分析的得力工具

在群体遗传学研究中，我们常常渴望揭开不同群体之间复杂的遗传关系以及基因流动的神秘面纱。Treemix 是一款专注于推断群体间基因流的软件。它通过构建群体遗传模型，能够有效地分析群体间的遗传...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2025-04-30 10:31
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deepseek绘图之--系统发育树

在群体遗传学研究中，构建系统发育树是解析群体遗传结构和演化历史的核心手段。无论是单核苷酸多态性（SNP）分析、单倍型网络构建，还是群体分化研究，研究者常面临一个挑战：如何将复杂的群体...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2025-04-30 09:42
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用Ai助手帮我写脚本

当我们想在linux下批量处理数据时，用到的脚本需要达到我们想要处理的效果，这时就需要我们对脚本进行修改编写。 但是对于初学者来说，一些生信脚本是非常晦涩难懂的，google百度得到的回答也...

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  • rzx
  • 发布于 2025-04-28 16:15
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deepseek绘图之--微生物堆叠柱状图

在微生物组研究中，揭示群落组成与动态变化是核心任务。无论是16S rRNA测序、宏基因组分析，还是环境样本的物种丰度比较，研究者常需面对一个关键问题：如何直观展示多个样本在不同分类水平（如...

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  • xun
  • 发布于 2025-04-28 16:09
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R脚本绘制多层环形饼图

“ 饼图（扇形图）时常用于对统计数据的可视化，在 R中，很多R包用于绘制饼图，例如ggplot2、ggsunburst就能绘制出好看的饼图，操作如下” 1. 加载所需要的包 library(RColorBrewer)  #调色模板...

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  • rzx
  • 发布于 2025-04-27 17:35
  • 阅读 ( 663 )

如何计算基因组中的连锁不平衡

连锁不平衡（linkage disequilibrium,LD）是指在某一个群体中，不同位置上的两个基因座同时遗传的频率明显高于预期的随机频率现象，一般用D，D'和r²来表示LD的程度。

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GATK配置问题的解决

GATK是我们重测序流程中经常使用到的软件，他的下载比较简单，但是今天在配置的时候出现了一点小问题 下载 wget https://github.com/broadinstitute/gatk/archive/refs/tags/4.6.2.0.tar.gzta...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2025-04-23 15:15
  • 阅读 ( 470 )