NCBI 中搜索某类基因蛋白序列技巧

NCBI上下载种子基因的蛋白质序列,可用于鉴定没有Pfamily好的基因家族。

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-11-13 21:49
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再挖TCGA,发篇SCI

再一次给大家介绍一篇不用做实验,只需要进行TCGA数据库挖掘,就能发的SCI的金思路

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  • microRNA
  • 发布于 2018-11-09 17:40
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ncbi基因组数据格式转换

ncbi基因组数据格式转换

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  • 安生水
  • 发布于 2018-11-09 17:32
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R的几个内置常量

R里面有几个内置常量,方便我们直接调用而非创建: 1、26个字母LETTERS, 小写字母怎么办? 有letters > LETTERS [1] "A" "B" "C" "D" "E" "F" "G" "H" "I" "J" "K" "L" "M" "N" "O" "P" "Q...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-11-09 17:07
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VennDiagram各区域信息提取

VennDiagram是进行Venn图绘制的 R包,最多能够绘制五组数据,其中一个主要的绘图函数为venn.diagram() 针对该参数相关的参数调整,可以直接对Venn图的颜色字体等多主题进行修改。而其绘图数据...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-11-09 15:37
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bedtools统计序列中碱基含量

bedtools统计序列中碱基含量

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  • 安生水
  • 发布于 2018-11-09 14:05
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clustalW命令行批量多序列比对

clustalw批量多序列比对

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-11-09 14:03
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小麦TCP基因家族分析文献解读及原文献下载

小麦TCP基因家族分析原文献下载(点此链接):Genome-Wide Identification and Expression Profiling of the TCP Family Genes in Spike and Grain Development of Wheat (Triticum aestivum L....

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  • 红橙子
  • 发布于 2018-11-05 21:38
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Vennerable包venn返回结果绘图

Vennerable包绘图过程  是由Venn函数 对各组数据构成的列表 进行处理返回一个Venn 对象,该对象是s4 譬如:  library(Vennerable)data(StemCell)w <- Venn(Sets=StemCell[1:2])plot(w, typ...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-11-02 15:16
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rgb函数选择颜色(并控制深浅)

R语言绘图过程中,常会使用颜色值,有时无法直接控制图片颜色的透明度,可以基于rgb()获取颜色,控制颜色深浅。 例如显示一下 红色: barplot(1,1,col="red")  当col="red"  或者col="#FF000...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-11-02 14:48
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Vennerable绘图组别名称(标签)位置调整

利用Vennerable可以进行绘图,以包自带的数据绘图如下: library(Vennerable)data(StemCell)w <- Venn(Sets=StemCell[1:2])plot(w, type="squares") 组别标签位置进行调整  可以基于Venn...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-11-02 13:35
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linux中gcc与pip安装

linux中gcc与pip安装

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  • 安生水
  • 发布于 2018-11-02 13:24
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linux下ClustalW2安装

linux下ClustalW2安装

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  • 安生水
  • 发布于 2018-11-02 13:16
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蛋白质组与转录组的关联分析如何做?

蛋白质组学和转录组联合分析该如何做?

COX 生存分析模型

COX 生存分析模型

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  • microRNA
  • 发布于 2018-11-01 17:57
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解决R中devtools安装github软件包遇到“SSL connect error”的问题

解决R中devtools安装github软件包遇到“SSL connect error”的问题

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  • microRNA
  • 发布于 2018-11-01 17:26
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pheatmap绘制聚类热图

R语言里面能够绘制热图的方法非常多,除了基本函数外还涉及了多种R包,其中一个包是pheatmap。 pheatmap意为pretty heatmaps,是一个非常有效且能快速绘制出聚类热图的R包,其绘图函数pheatmap...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-10-30 11:24
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Vennerable包的安装

Vennerable包并没有在CRAN,所以他的安装需要提供相应的链接,其安装方法可以在:http://r-forge.r-project.org/projects/vennerable 找到,或者  https://github.com/js229/Vennerable  后者...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-10-26 16:18
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linux下perl及bioperl安装

linux下perl及bioperl安装

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  • 安生水
  • 发布于 2018-10-26 14:27
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linux下Circos安装

linux下Circos安装

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  • 安生水
  • 发布于 2018-10-26 14:15
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