TWAS分析的原理和工具
TWAS（Transcriptome-wide Association Study）是一种用于研究基因表达和疾病之间关系的方法，通过对全基因组的基因表达数据进行统计分析，以识别与特定疾病或性状相关的基因表达变异。
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- 每天学习一点点
- 发布于 2024-11-12 17:29
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每天学习一点点
安生水
samtools | 提取部分染色体的bam信息
01. samtools提取bam文件中某部分染色体相关信息 samtools view -b -h XX.bam chr1 chr4 >XX2.bam 02. samtools构建bam文件的索引 samtools index XX2.bam
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- rzx
- 发布于 2024-12-19 16:28
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rzx
PASA报错：unique constraint failed: asmbl_link.asmbl_acc, asmbl_link.cdna_acc
通常会从同源、转录组、从头三个方面进行基因结构注释，其中PASA是转录组注释的常用软件。 报错： 把三代转录组数据投入PASA是出现报错：unique constraint failed: asmbl_link.asmbl_acc, as...
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- Ti Amo
- 发布于 2024-09-30 13:50
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Ti Amo
HiC-Pro 报错检索解决
报错： 运行HiC-Pro的时候出现报错： 去看log文件发现： 只能知道是在比对的step1就出现了问题。 问题查找： 此时我们需要去HiC-Pro的scripts文件夹下面去查看Makefile这个文件，看一...
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- Ti Amo
- 发布于 2024-10-28 15:12
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SRA Toolkit 工具首次使用提示“This sra toolkit installation has not been configured”
SRA Toolkit 是一套由 NCBI (National Center for Biotechnology Information) 开发的软件工具，用于从 SRA (Sequence Read Archive) 数据库下载和处理生物序列数据。
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- 每天学习一点点
- 发布于 2024-09-09 16:31
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Treemix 软件：群体基因交流分析的得力工具
在群体遗传学研究中，我们常常渴望揭开不同群体之间复杂的遗传关系以及基因流动的神秘面纱。Treemix 是一款专注于推断群体间基因流的软件。它通过构建群体遗传模型，能够有效地分析群体间的遗传...
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- Ti Amo
- 发布于 2025-04-30 10:31
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pfamscan程序-translate和python的translate冲突问题
pfamscan程序-translate和python的translate冲突
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- Ti Amo
- 发布于 2024-08-27 16:44
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让AI帮你处理数据，绘制图表！让你强到可怕！
随着DeepSeek等AI人工智能的迅猛发展，我们作为新时代的生命科学从业人员也要充分利用时代红利来辅助我们的研究。今天要给大家推荐2场超实用的直播小课-《让AI帮你绘图》和《让AI帮你处理数据》...
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- 红橙子
- 发布于 2025-04-16 20:39
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红橙子
hisat2-build报错：Error: Encountered internal HISAT2 exception (#1)
hisat2-build报错：Error: Encountered internal HISAT2 exception (#1)
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- 安生水
- 发布于 2024-12-11 15:15
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perl报错：symbol lookup error: xxxxx: undefined symbol: Perl_xs_handshake
glimmhmm是一个基因从头预测的软件，他的运行需要先训练模型再预测基因 报错： 运行trainGlimmerHMM的时候出现报错”undefined symbol: Perl_xs_handshake“ 问题： per调用的lib里面没有相关...
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- Ti Amo
- 发布于 2024-10-22 13:55
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xun
ifconfig不显示ip
如题,在ifconfig的时候如果没有出现IP地址,同时确保自己网络连接没问题 nmcli con show NAME UUID TYPE DEVICE eno1 1377a295-708b-4cb4-a1cb-0...
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- xun
- 发布于 2024-10-10 15:57
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seqkit | 对fa序列文件中序列长度进行筛选
seqkit seq -m 50 XX.fa > XX1.fa 将XX.fa文件中序列长度低于50的序列删除
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- rzx
- 发布于 2024-11-19 19:01
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AI写代码之批量设计引物
我们拿到一段序列之后想要设计引物通常会使用ncbi或者是primer3工具，而这些工具的在线版本都只能一个一个序列去设计，比较耗费时间，最好是使用本地版。在这里我让AI告诉我怎么做，只要阐述清...
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- Ti Amo
- 发布于 2025-03-17 17:40
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BaiduPCS-Go 报错 | 上传文件失败, 分片上传—合并分片文件: 遇到错误, 远端服务器返回错误, 代码: 31352, 消息: commit superfile2 failed
在使用BaiduPCS-Go上传文件时报错： [1] ↑ 1.03GB/1.03GB 1.81MB/s in 39s ............[1] 上传文件失败, 分片上传—合并分片文件: 遇到错误, 远端服务器返回错误, 代码: 31352, 消息: commit...
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- rzx
- 发布于 2024-12-19 17:17
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linux 编码转换
在linux里面编辑二进制文件有以下两种方法： 1. vim 打开二进制文件： vim -b 文件 将内容转换成16进制： :%!xxd 转换回来： :%!xxd -r 2. iconv # 将UTF-8编码的wx.txt文件转换为GB...
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- Ti Amo
- 发布于 2024-12-03 14:56
- 阅读 ( 837 )
