总有人问：“基因家族分析还能发文章吗？”当你还在犹豫时，人家已经向2区期刊进发了！今天给大家分享一篇2021年7月8日（上周四）发表于BMC Plant Biology（2区，IF=3.497）题为“Genome-wide analysis of MYB transcription factors and their responses to salt stress in Casuarina equisetifolia.”的基因家族分析文章，看看它是如何发到2区期刊的。

文章简介

MYB是植物中最大的转录因子家族之一，是一类能与真核基因启动子区域特异性相互作用的DNA结合蛋白，MYB转录因子通过彼此之间或与其他相关蛋白之间的相互作用调控基因的表达。MYB家族已见报道于多种植物，木麻黄中仍未见报道，故作者通过本文系统研究了木麻黄中MYB家族情况及其在盐胁迫中的响应机制。

文章内容

1. 木麻黄中MYB家族基因的鉴定
作者通过下载MYB隐马可夫模型，通过HMM软件鉴定MYB家族基因，共鉴定出182个MYB家族基因，命名为CeqMYB1— CeqMYB182；分析了序列长度、等电点及表达部位等信息。

2. 木麻黄MYB家族基因进化及分类分析

作者根据MYB保守结构域数量将该家族分为3个类型：69个1R-MYB 蛋白、107个R2R3-MYB 蛋白和4个R1R2R3-MYB蛋白，分别构建了拟南芥MYB和木麻黄MYB家族基因系统发育树，比较发现木麻黄MYB分群和拟南芥中MYB分群具有较高的一致性，如下图：

3. 木麻黄MYB基因结构和Motif分析

作者进一步分析MYB家族基因的Motif，并按不同分群分别介绍了相应Motif特点及可能的功能。

4. MYB家族直系同源与旁系同源基因

作者根据系统发育树和BLASTN方法，共鉴定出53个直系同源基因和54个旁系同源基因，并计算Ka/Ks，发现负向选择（纯化选择）在木麻黄MYB家族基因进化中起重要作用。

5. 木麻黄MYB家族基因表达谱分析及Go功能注释

根据转录组数据，作者分析了200mm Nacl不同处理时间下182个MYB基因的表达情况及功能注释信息。

6. MYB家族基因顺式作用元件分析

作者分析了182个MYB家族基因启动子区域顺式作用元件，并绘图展示了32个基因中激素响应、植物生长与发育和生物/非生物胁迫3类顺式作用元件。

7. 木麻黄MYB家族基因表达QPCR验证

QPCR验证是必须要做的，作者选了32个MYB家族基因，验证了其在不同盐浓度下根和茎中的表达情况。

总结

以上就是该篇基因家族文章的全部内容，除了QPCR外均为生信分析内容，那么他是如何发到2区期刊的？我读这篇文章后最大的感触是写的很细致，比如系统发育树部分与拟南芥MYB的比较，Motif分析以及表达热图QPCR验证部分，佐证之图表也较其他3-4区文章要多；至于其他写作技巧、英文功底这里不做评判。基因家族分析发2区文章现在也是越来越多，小编简单检索了一下就发现2021年上半年就近180篇。

基因家族+高级分析或者基因家族分析+实验发2区期刊，较其他实验类文章还是相对比较容易的，那么都有哪些高级分析？需要做哪些实验呢？假如您有此类发文需求请加微信：llcheng1314，我们将免费为您设计文章方案！

日常科研中你我经会常遇到看不懂的图表，不会挖掘的数据，没有思路的文章，沟通不畅的个性化分析，求人不如求己，一切痛点都能解决：

1. 单细胞/空间转录组正在大火，高分文章必备，0基础学单细胞/空间转录组分析，做更牛的个性化分析，绘更漂亮的图，点这个链接：单细胞/空间转录组分析实操 

2. 2区文章发文新思路，0实验就能发文章，省钱省时间，套路化内容好写易发表，0基础学习最新版基因家族分析/泛基因家族分析链接：最新基因家族分析 ；最新版泛基因家族分析

3. 转录组越做越普遍，实验必备，看不懂结果？不会深入分析？自学都可以搞定，学习链接：有参转录组自主分析实操 ；转录组与代谢组结果解读/个性化数据分析 ； 

4. 代谢组分析硬件要求不高，个人电脑就可以分析，0基础学习链接：代谢组分析实操

3. 现在才是发表T2T基因组/泛基因组文章的好时机，成本低，好发表，做好高级个性化分析发表高分1区不是梦！T2T基因组/比较基因组/泛基因组分析学习链接：T2T基因组组装与注释分析；动植物泛基因组分析 ；比较基因组分析

4. 群体重测序遗传进化分析+GWAS文章，篇篇10+分，缩短分析周期，提升文章亮点，勇敢冲击NGS顶刊，学习链接：群体遗传进化GWAS分析 ；

5. 传统图位克隆研究方法经久不衰，有遗传群体，有性状，自己就可以做，学习链接：遗传图谱构建与QTL分析

6. 微生物16S/18S/ITS多样性分析和宏基因组分析，学习链接：宏基因组分析 ；微生物16S/18s/ITS多样性分析

7. 细胞器基因组与比较基因组分析是真正的无需实验就可以发表2区期刊的文章思路，成本低，文章好发，性价比极高，学习链接：线粒体基因组分析实操 ；叶绿体基因组分析实操

8. 数据分析硬件利器，个人分析能力的倍增器，好用便宜的云生信服务器，专门为高通量测序数据分析而生，了解链接：云生信服务器

9. 免费好课，个人能力提升，生信入门，不可错过，内容涵盖：生信语言与工具基础、R语言绘图、常见科研绘图、数据处理技能等，免费好课总入口：

点我开启学习之旅

10. 更多学习内容：linux、perl、R语言画图，更多免费课程请点击进入组学大讲堂网校学习