上一期给大家介绍了使用DNAman进行多重序列比对的方法,想了解的可以点击链接查看:多序列比对分析-Dnaman很好用!其实DNAman还有很多其他功能,今天我在和大家分享一下。
绘制质粒图谱是DNAman比较成熟的功能之一,装载好质粒序列后(装载方法见:多序列比对分析-Dnaman很好用!)进行如下操作:点击Restriction-Draw Map,然后双击对话框右侧箭头所指即可打开参数设置对话框,如下如:
General是图参数常规设置,具体参数含义见下图:
Elements比较重要,是添加元件的选项,可以设置元件类型颜色及命名,元件设置成功后鼠标选中还可以移动位置。
Text可以添加文字及设置文字格式;Sites可以添加酶切位点;Drawing可以绘制着重框,成品图见下方:
DNAman可以多形式展示序列信息,可通过复选框选择所需内容形式:如下:
DNAman可以快速翻译蛋白质序列,操作也非常简单,参数设置及结果见下图:
DNAman提供快速NCBI比对功能,并提供多种比对形式,如下图:
DNAman提供开放阅读框预测,如下图,可展示氨基酸氨基酸数量、起止位置:
DNAman除了以上功能外,还有其他功能,如设计PCR引物、检索SiRNA等,但是个人感觉不是很好用,所以这里就不再细述了,感兴趣的可以自己尝试下!
日常科研中你我经会常遇到看不懂的图表,不会挖掘的数据,没有思路的文章,沟通不畅的个性化分析,求人不如求己,一切痛点都能解决:
1. 单细胞/空间转录组正在大火,高分文章必备,0基础学单细胞/空间转录组分析,做更牛的个性化分析,绘更漂亮的图,点这个链接:单细胞/空间转录组分析实操
2. 2区文章发文新思路,0实验就能发文章,省钱省时间,套路化内容好写易发表,0基础学习最新版基因家族分析/泛基因家族分析链接:最新基因家族分析 ;最新版泛基因家族分析
3. 转录组越做越普遍,实验必备,看不懂结果?不会深入分析?自学都可以搞定,学习链接:有参转录组自主分析实操 ;转录组与代谢组结果解读/个性化数据分析 ;
4. 代谢组分析硬件要求不高,个人电脑就可以分析,0基础学习链接:代谢组分析实操
3. 现在才是发表T2T基因组/泛基因组文章的好时机,成本低,好发表,做好高级个性化分析发表高分1区不是梦!T2T基因组/比较基因组/泛基因组分析学习链接:T2T基因组组装与注释分析;动植物泛基因组分析 ;比较基因组分析
4. 群体重测序遗传进化分析+GWAS文章,篇篇10+分,缩短分析周期,提升文章亮点,勇敢冲击NGS顶刊,学习链接:群体遗传进化GWAS分析 ;
5. 传统图位克隆研究方法经久不衰,有遗传群体,有性状,自己就可以做,学习链接:遗传图谱构建与QTL分析
6. 微生物16S/18S/ITS多样性分析和宏基因组分析,学习链接:宏基因组分析 ;微生物16S/18s/ITS多样性分析
7. 细胞器基因组与比较基因组分析是真正的无需实验就可以发表2区期刊的文章思路,成本低,文章好发,性价比极高,学习链接:线粒体基因组分析实操 ;叶绿体基因组分析实操
8. 数据分析硬件利器,个人分析能力的倍增器,好用便宜的云生信服务器,专门为高通量测序数据分析而生,了解链接:云生信服务器
9. 免费好课,个人能力提升,生信入门,不可错过,内容涵盖:生信语言与工具基础、R语言绘图、常见科研绘图、数据处理技能等,免费好课总入口:
10. 更多学习内容:linux、perl、R语言画图,更多免费课程请点击进入组学大讲堂网校学习
如果觉得我的文章对您有用,请随意打赏。你的支持将鼓励我继续创作!