共线性分析的原理，这里可以简单的说明一下：例如这里有两个基因组分别来自不同的物种，将两个基因组当中所有的基因互相用blast比对，然后MCScanX会利用比对关系，发现基因组之间的共线性关系，例如下图，两个红方框之间有一串基因存在很强的同源性，且一一对应，那么就可以认为两个基因组之间的这两个区段存在共线性关系。
这只是简单的原理，感兴趣的同学可以查看MCScanX算法的详细说明：
https://academic.oup.com/nar/article/40/7/e49/1202057
使用参考：https://www.omicsclass.com/article/275
