找到约 15 条结果

问题 处理临床数据时,只有xlsx工作表,没有xlm文件。应该怎么用r处理数据?

文章 R语言、文件读取(2

...)#读取该文档,文档首行为标题,用逗号分隔开 #二、xlsx文档的导入 #以123.xlsx文档为例library(xlsx)#调用xlsx函数包data<-read.xlsx("123.xlsx",1)#读取123.xlsx文档,在该文档的1表中

文章 readxl包读取excel的多个函数简介

readxl包括多个可以读取excel的函数,不需要与包“xlsx"中的read.xlsx()函数一样去调用java ("xlsx" 应用是需同时安装"xlsxjars","rJava")例如readxl包的函数read_xlsx()读xlsxsheet1=read_xlsx("Cici.xlsx",sheet = 1)> sheet1# A tibble: 1 x 3      A...

问题 老师,我分析的物种是6倍体,参数需要变动嘛?

gatk --java-options '-Xmx40g' HaplotypeCaller -R $REF    --max-alternate-alleles 4  --sample-ploidy 2 -O  all.raw.vcf.gz    -I 1.sorted.dedup.bam  -I 2.sorted.dedup.bam  --tmp-dir tmp

文章 read.xlsx读取Excel文件

读取Excel文件 先安装"xlsx"(安装过程会同时安装成功"xlsxjars","rJava") install.packages("xlsx")library('xlsx')library('xlsxjars')library('rJava') 准备的数据文件read.xls涉及两个sheet > sheet1 = read.xlsx("read.xls",1) ##sheet对应第一个> sheet1 Samples Num1 ...

文章 cox模型评估-决策曲线分析(DCA)

...,将改变出血与血栓形成之间的利弊平衡,利弊之差即为获益(Y轴:Net benefit).图中有两条虚线,横着的那条虚线表示所有样本均不进行干预,获益为0,斜的虚线表示所有样本均进行干预。三条彩色曲线表示三种方案(模...

文章 2018年最新期刊分区变动(1-4区)+2018影响因子汇总表-生命科学类免费下载

...AS、Science Advances等著名期刊均被列入二区,引来无数科研工作者diss纷纷!要知道很多高校、科研单位都是把“中科院分区”作为招聘、职称晋升、年终考核标准的,估计今年发NC、PNAS的要哭晕在厕所了。 当然,有哭就有笑,...

文章 重磅!2018年最新期刊分区变动(1-4区)+2018影响因子汇总表-生命科学类免费下载

...AS、Science Advances等著名期刊均被列入二区,引来无数科研工作者diss纷纷!要知道很多高校、科研单位都是把“中科院分区”作为招聘、职称晋升、年终考核标准的,估计今年发NC、PNAS的要哭晕在厕所了。 当然,有哭就有笑,...

文章 OthroFinder-物种同源基因分析工作原理

...之外,还可以使用OrthoMCL,今天主要介绍Orthofinder软件的工作流程。 1. Orthofinder发表的工作流程如上图:     1.1 (a)将所有物种的全部蛋白序列通过序列比对和调用MCL聚类实现同源分类,推断出同源基因集合(Orthogroup); ...

文章 混合线性模型中BLUE值 VS BLUP值

...2,h2 ~ V3/(V3 + V4/4 + V5/(2*4))) 将数据保存到excel中 library(openxlsx) write.xlsx(blue1,"blue.xlsx") write.xlsx(blup2,"blup.xlsx") write.xlsx(pv1,"pm1.xlsx") write.xlsx(pv2,"pm2.xlsx") 结果解析 RIL是基因型 pm2-random是RIL作为随机因子的预测均值 pm1-fixed是RIL作为...

文章 科学分析:国自然的评委都是哪些人?

...责人的关注,往往也会被邀请参加国家自然科学基金函评工作, 大家可以多关注自己领域的新闻。 可能性三:专家推荐 学霸姐姐听说过某医院里的一位大佬主任收到国家自然科学基金委某学部某处长的邀请函, 写到某某...

文章 16S多样性分析docker镜像发布及使用

...er8_97_04.02.2020.txt 2.合并双端reads,flash cd $workdir  #回到工作目录mkdir 1.merge_pefor i in  `cat $fastmap |grep -v '#'|cut -f 1` ;do     echo "RUN CMD: flash $datadir/${i}_1.fastq.gz $datadir/${i}_2.fastq.gz \        -m 10 -x 0.2 -p 33 -t 1...

文章 使用map()、filter()来做到函数式编程

一般来说,大部分工作的规模不至于需要定义类,可是顺着下去写代码在之后的调试,修改都比较麻烦,这种情况下,可以尝试使用函数式编程 函数式编程,顾名思义,整个代码都由相互独立的纯函数构成,而且参数和返回值...

文章 tassel 软件做GWAS关联分析多年多点表型数据整理格式

...m/esm/art%3A10.1038%2Fng.3807/MediaObjects/41588_2017_BFng3807_MOESM68_ESM.xlsx

话题 read.xlsx