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问题 求助WGCNA Hub基因选择问题

1. 先筛选GS＞0.2，MM>0.8的基因，然后将其中的连通性高的基因选做hub gene可以吗？ 2. MM大于0.8是指在自身所在的模块MM值吗？那此基因在其他模块中的MM值有什么意义吗？ 3. 怎么看一个基因与其他模块中基因的连通性？（举个...

问题 基因组组装后进行merqury评估出现问题

...问这是什么原因？ 还有个问题是map运行过程中提示如图2，但是我查看了fai文件（图3），染色体名称似乎没有问题，请问这是怎么回事？

问题 两个基因是片段重复基因对，序列完全一致，但是KA/KS值为NA

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文章 如何打印机连接打印机

打印机型号：HP LaserJet Pro MFP M227fdw 连接方法： 1.下载驱动 驱动下载地址：https://support.hp.com/cn-zh/drivers/selfservice/hp-laserjet-pro-mfp-m227-series/9365384 2.安装驱动 双击下载好的驱动程序开始安装。 选择自动设置。 列...

文章 linux清屏的几种方式

...入新命令时，会使用 clear 命令或 reset命令清空当前屏幕2.快捷键也能实现相同的功能：ctrl + l(小写的L)3.经常会遇到这种情况：在命令行窗口输入了很长的一段命令加命令参数，却发现输入错了，想清空怎么办呢 ?清空当前输入...

问题 CCS报错---unsupported sequencing chemistry combination

|> 20250317 15:57:04.699 -|- FATAL -|- Runner -|- 0x7fb76cda1780|| -|- unsupported sequencing chemistry combination: binding kit: 100236500 sequencing kit: 100356200 basecaller version: 2.3.0.0.140640 另外尝试了不同的ccs版本都报一样错,有遇到过同样问题的大佬求指教...

问题 学习有参转录组分析中遇见的问题

...的步骤操作，但是第一个问题就难住了我，我在使用hisat2_extract_splice_sites.py的时候，系统提醒这个命令找不到，如图片所示，这是怎么回事呢？我用的是Linux系统虚拟机操作的。感谢回答！

文章 DELL R430服务器用U盘安装Linux步骤

DELL R430服务器用U盘安装Linux步骤： 1、  第一步制作U盘启动，将下载好的CentOS64位系统用UitraISO打开，写入硬盘映像。 2、  注意选择U盘，最后写入 启动盘制作好，设置从U盘启动

问题 请问为大神，这种情况该怎么处理？

具体代码如下 ： workdir="C:/Users/dong/Desktop/2/GSE40807_RAW"setwd(workdir)dir.create("result") files = list.files(workdir, pattern = "GSM")filesRawData=read.maimages(files=files,source="agilent.median",green.only = T)show(RawData) EListRaw=RawDatadim(EListRaw)colnames(EListRaw) BgC...

问题 你好老师有关网络图绘制的问题

...怎么操作呢(因为网上看到的博客写到这个地方就没了)，2.用Cytoscape软件中CoNet插件绘制网络图时老是出现错误这个是怎么回事具体参数是怎么设置的呢

文章 VirusDetect-小RNA鉴定病毒

...数据与宿主基因组进行比对，过滤掉来源于宿主的序列 2. 没有比对上的序列，进行denovo 组装 3. denovo 的序列与已知的病毒库进行比对，找到相似度高的病毒序列 VirusDetect 是一个小RNA鉴定的病毒的分析流程，非常的好用，并且...

问题 老师，我在学习基因家族视频，用perl脚本预测基因顺式作用元件时出现了问题，提取不了位置信息

...et_gene_weizhi，得到gene_weizhi.txt文件，如下图 一共得到了2万多个结果，我的基因一共才六十几个，我查看了一下GFF文件（下图），发现这2万多个结果（就是NW开头这一栏）是GFF里面所有注释的gene，也就是说不是按照我的基因ID...

问题 老师您好，请问我mac电脑如何启动镜像

docker run -it -m 3G --cpus 1 --rm -v D:/ampliseq-q1:/work omicsclass/ampliseq-docker run -it -m 3G --cpus 1 --rm -v D:/ampliseq-q1:/work omicsclass/ampliseq-q1:v1.2 这是您的代码。我的存放的文件地址是/Users/wuzhengyuan/Desktop/1/qiime1

问题 GWAS分析中，Emmax对于SNP数量是否有要求？

各位大佬好，最近在用Emmax进行GWAS全基因组关联分析研究。但发现前面得到的6千万个SNP位点，但在emmax-intel64后仅有前2千万个SNP进行了分析。请问这类软件对于SNP数量有要求吗？

文章 linux-列合并

...右排起来，例如文件1的内容是： HelloHelloHelloHello 文件2： WorldWorldWorldWorld 则合并之后的结果为： Hello   WorldHello   WorldHello   WorldHello   World 命令为: paste file1 file2 > result 参数 -d 可指定连接符： paste -d '@' file1 file2 > res...