... 首先小编简单介绍下这篇被二次挖掘多次的单细胞数据分析的原文，这篇文章的主要内容如下： 作者选取了10个肝癌病人共21个样本，取样类型包括：primary tumor (T)、portal vein tumor thrombus (P)、metastatic lymph node (L)、non-tumor liver (N...
老师您好，请问下：基因家族成员中某一成员的蛋白序列起始氨基酸不是甲硫氨酸，请问下这样的成员还要列入该家族中吗？是不是不需要将该基因进行后续分析了？ 谢谢老师的解答
做毕业设计：在对比分析完开始建树会出现下面图片的错误，对比了7个物种的同一个酶的基因，我自己实在不知道咋办，6条序列是ncbi下载的，有一条是测序序列，非常感谢
...具，用于检测基因的剪接事件。rMATS Turbo 是 rMATS 的改进版本，专注于更高的性能和更快的速度，能够允许不同长度的reads进行分析。 rMATS可识别的可变剪切事件有5种: skipped exon (SE)，外显子跳跃，指一个或多个外显子连同其两...
...一下：1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结...
...而使得数据在各个数量级上的分布更加均匀，便于观察和分析。 结果如下： 2. 特定尺度变化——自己写一些简单函数进行转换 原始数据： 代码： # 自定义正向变换函数custom_transform <- function(x) { ifelse(x <= 100, x, ifelse...
在我们的《TCGA差异表达分析》课程中，我们介绍了采用TCGAbiolinks 去下载GDC上的TCGA数据。但是最近有学员想基于“Primary Site” 筛选一下样本，只对其中的一种类型进行分析。 如下图所示： 我查看了一下TCGAbiolinks的文档，发现...
...下： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）...
...升了对样品信息的认知。 质谱成像技术是一种结合质谱分析和影像可视化的分子成像技术，通常不需要标记，对生物组织样品可进行多点检测、多维数据获取，可实现不同分子高灵敏度的同时检测，并能够直接提供目标化合物...
...是v22，现在文章用的也都不一样，不懂这些差距对于后续分析的影响大吗。 然后我用R提取了v28的ensemble ID ，gene symbol 和biotyoe。 lncRNA是没问题的，都能正常与老师提供的对应上 对于mRNA的信息有点出入，不知道如何择选的，因...
...lity-check QUALITY_CHECK 选择CheckM版本，默认`checkm`，可指定`checkm2`，例如： `-qc checkm2`用于质量检查。 --min-cpn MIN_COMPLETENESS 过滤保留bin的最小...
老师，您好！我在茄科数据库下载烟草基因组数据，有chr和scf两种，我该下载哪一个版本呢？
...书，但是最近神经领域权威杂志《Neuron》上的一篇大数据分析文章发现，其实老年痴呆很可能与病毒感染有关，这将完全颠覆我们的认知，同时这也突显了生物信息数据挖掘在生命医学中的重要性。下面我们来简单看看这篇文章...
...一句话甚至一个标题的。（举例：标题是“如何做转录组分析？”，内容是：“如题”）问题中完全没有自己的观点，也就是传说中的伸手党。伸手党的存在主要有两大害处，第一，你没有说出已经尝试过哪些方法，没有尽量为...
...*** [khmm.so] Error 1 本人谷歌和查找说明文档，说GCC必须是4版本，而且perl版本要低于5.14.2:，于是安装低版本perl： wget https://www.cpan.org/src/5.0/perl-5.14.2.tar.gz tar xvfz perl-5.14.2.tar.gzcd perl-5.14.2./Configure -des -Dprefix=/share/work/perl/perl-v5.14.2...