问题 网络分析中在MENA中做出环境因子和OTU之间的联系之后，怎么在Cytoscape中可视化呢？谢谢老师

就是这些步骤完成之后如何可视化，https://www.omicsclass.com/article/558

文章 linux命令详解之ls

ls命令目录基本操作 ls命令用来显示目标列表，在Linux中是使用率较高的命令。ls命令的输出信息可以进行彩色加亮显示，以分区不同类型的文件。 语法ls（选项）（参数）选项-a：显示所有档案及目录（ls内定将档案名或目录名...

问题 你好，老师。同一个基因用视频流程获取的启动子序列2kp，是mRNA前面的2kp，不是CDS区前的2kb.现在提取的启动子都是CDS区前的2kb啊，mRNA与CDS区的注释长度不同，就导致我们获得启动子区域不正确

问题 大牛好，我用conda安装了perl之后，然后调用perl的时候报错说我缺少Bio：：Sioq这个模块，请问接下来该如何用conda安装perl模块呢？还是只能用其他方式安装，那又该如何将这个模块和conda安装的perl联系起来呢？求解

问题 老师，您好，我想请问一下，就是XPCLR计算的时候（老版的），我看你的博文写的（https://www.omicsclass.com/article/1334)遗传距离(可简单的物理距离/100000000)，就是我写论文计算也可以直接用这样简单表示遗传距离吗，还是必须根据遗传图谱的统一重组率呀。谢谢

问题 从ncbi中下载了sra文件到Linux中，如何把文件格式转换为fastq格式呢，复制文章中的命令显示报错

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问题 在Rstudio中进行样品聚类，在plots中图片显示不出来

在Rstudio中进行样品聚类，在plots中图片显示不出来，自动生成的pdf文件也打不开，说是损坏。 输入的代码和输出的代码请见图片。 请求帮助，非常感谢！

文章 18年上半年，利用GEO/TCGA数据库发表文章超过1000+

...rove prognosis prediction of colorectal cancer ，该文采用TCGA数据库中结直肠癌及癌旁组织的mRNA，lncRNA,miRNA进行差异表达，获得显著变化的分子，用于构建生存分析模型，获得疾病风险评估方法。   2：Elevated circulating miR-182 acts as a diagn...

文章 GSDS绘图编辑器导出矢量图

...。接下来就很简单了，把它全选复制，然后粘贴到TXT文件中，最后将后缀名改为 .svg  就可以啦。 此外，我们在网易云课堂上有各种教学视频，有兴趣可以了解一下： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分...

问题 基因家族分析--定量问题

老师您好，我想问一下后面的定量分析可以用不同的种吗？用于鉴定的物种和定量用的物种拉丁文不太一样

文章 转录组如何与其他实验手段结合？（第二篇文献）

上一期，我们一起了解了积雪草苷合成过程中糖基化反应的转录组文章，今天我们来看第二篇同样以这个转录组数据为基础的第二篇SCI文章，这一次作者关注点更加细致，下面听我娓娓道来：积雪草酸是由香树脂醇α-amyrin在C-2α,...

问题 老师您好，我在做宏基因组学分析时，由于样本数据量过大，将所有样本质控后的reads用进行组装时，会出现服务器内存不足无法组装的情况。那我想将每个样本的数据分别组装，然后将样本contig文件进行合并后再进行下游分析。这种方法可行吗？

文章 Root microbiota assembly and adaptive differentiation among European Arabidopsis populations

...2017年每年拟南芥开花阶段，作者沿着纬度梯度取样。其中，在瑞典有四个采样点，在德国有六个采样点，在法国有三个采样点，在意大利有一个采样点，在西班牙有三个采样点，一共17个采样点（图1a）。分别收集拟南芥和其共...

文章 论文被拒稿11次，还有必要再投吗？

...往就是现实。 古话说：事不过三。 大部分人心里接受不了被拒3次或者3次以上，但其实，真的被实打实拒3次的情况在我看来也不是特别的多， 如果你真的特别拧巴，非要在一棵树上吊死那当我没说， 很多时候这就是一个...

问题 如何下载NCBI中SAR数据库中的数据？