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宏基因组binning后的mags,也可以用kegg注释出功能是嘛?是拿到mags的碱基序列,直接扔进官网去注释吗,还是也要基因预测,然后蛋白质序列再扔进官网去注释?或者用本地数据库?这方面的课程会有教学吗?
由于STRING数据库中没有丹参这个物种,所以我在搜索的时候选择了拟南芥。
可临时载入中文字体解决,设置方法如下: 1.加载中文字体 中文字体可到windows当中C:\Windows\Fonts 下的中文字体(SIMHEI.TTF 宋体)上传上去: reload(sys)sys.setdefaultencoding('utf8')from matplotlib.font_manager import FontPropertiesfont = FontProp...
...问题,目前正在学习生物信息这门课程,按照模型在银杏中提取到了200多个目的蛋白mega_id_pep.fa,下一步准备在目的蛋白质中提取motif的过程中,使用meme命令,设置请见图片,命令运行后就一直停在一个地方不动了,大概有2个多...
...am数据库的隐马尔可夫模型。记住模型下载是在pfam数据库中,选择你自己需要的模型即可,如若没有你需要的模型怎么办呢,这时我们可以自己建立模型,请看图3后一行码。2、在pfam数据没有模型的时候,我们可以利用clustalX2要...
如图所示这种类似的基因型图
Mac 中安装了virtual box,引入了bio-linux,但是一些命令无法操作怎么办?例如无法新建文件。无法新建txt,用了touch txt,mkdir txt都不行。求大神指导怎么在Mac虚拟机上操作bio-linux?万分感谢!
下面是运行图和输出文件