通过学习TCGA生存分析课程，得到了几个基因的risk score，但现在我想用自己的样本进行验证，是不是必须测序，就用定量pcr可以验证吗，该怎么计算？
官方使用说明：http://resources.qiagenbioinformatics.com/tech-notes/HGMD_Tech_Note.pdf 但是我们需要转换一下，使ANNOVAR能够支持vcf批量注释，转换perl脚本如下： perl ./prepare_hgmd.pl HGMD_PRO_2016.4_hg19.vcf hg19_HGMD_PRO_2016.4.txt my ($dbfile) = $ARGV[0];my ($o...
Bulked Segregant Analysis（BSA，集群分离分析法）是一种快速、有效的对分离群体进行质量性状或者数量性状主效基因进行定位的手段，具有适用范围广、群体要求低、实验成本低的优势。但是很多老师设计了实验、拿到数据之后，...
还有就是如果同一家族的蛋白结构是相似的，因为是3D，怎么让几个结构相似的蛋白放在一起的图片中，不同蛋白都展现的事相似结构的那面
...程、经纬度的线性模型，并计算模型的F统计量和对应的p值。 数据存在一个叫myData的data.frame中，数据前几列长下面这样： ID X Y Ele Temp1 50353 126.6333 51.73333 173.9 0.0550242 50468 127.4500 50.25000 166.4 1.619...
...aticsFMRP/TCGAbiolinks/tarball/master' 有没有大神能帮忙看看是个什么情况啊
...reFile构建idx索引都因为超出索引范围失败了，我的样有141个，所以用的是生成gvcf文件，现在我应该怎么办啊
...dtcd.xetslk.com/s/1VQOjQ 或者扫码二维码： 可以使用tassel GWAS分析软件 转换： perl /share/work/biosoft/tassel/tasseladmin-tassel-v5/run_pipeline.pl -Xms64G -Xmx64G -fork1 -vcf ../gwas_sub/snp.sorted.vcf -export ./hapmap -exportType Hapmap
...为系统发生树、聚类树或者进化树。它以树状结构表示各个节点的进化和亲缘关系，枝点可以是物种和基因等，在系统发育分析、基因家族和物种进化分析中经常会看到此类图片。 像这个 还有这个 是不是很漂亮？你的呢...
...如下： 首先关闭用户和组磁盘配额 xfs_quota -x -c "off -ug" /home 清除用户和组配额 xfs_quota -x -c "remove -ug" /home 卸载 umount /dev/mapper/rl_omicsclass-home 只保留用户配额功能 vi /etc/fstab 重新挂载 mount -a 重启服务器 reboot 查看 moun...
...选的，而后使用自己的转录组数据分析，相比之前多了几个基因，也就加进去了，使用虚拟机进一步分析了，在后期进行理化性质分析时发现虚拟机从基因组里调出来的蛋白质序列与NCBI上的蛋白质序列有出入（起初只是发现蛋...
qiime2 18S 分类器构建：V 2020.8 ##wget -c https://www.arb-silva.de/fileadmin/silva_databases/qiime/SILVA_132_QIIME_release.zip####unzip SILVA_132_QIIME_release.zipqiime tools import \ --type 'FeatureData[Sequence]' \ --input-path SILVA_132_QIIME_release/rep_set/rep_set_18S_only/99/silva...
老师好，请问一下根据HSF基因的pfam模型在转录组结果中找到2基因，这2个基因都是HSF吗？有什么区别，如果要克隆这个基因应该按照哪个
...源关系这一步最后画图时，现如下问题： 我一共做了5个物种的比较，以下是我的文件内容截图： 我看主要是TAO和FN的基因在bed文件里找不到，，但是我在bed文件手动搜索报错的第一对：evm.model.chr0.498 evm.model.chr0.533 ONI03914 ...
没有做任何修改，全靠 对话AI，利用AI给的R代码绘图结果，还是不错的： 这是对话链接大家可以看看：https://www.doubao.com/thread/w1d46b45b18549316