...是siRNA ? siRNA(small interfering RNA 小干扰RNA) 是由 20-25 个核苷酸组成的双链 RNA 分子。一般3’端有两个游离的碱基,通过RNA干扰途径沉默目标基因。 RNA干扰(RNAi) 在RNA干扰通路中,siRNA 通过与互补 mRNA 分子杂交干扰基因表...
...我在cytoscape中使用conet插件绘制互作网络图,我上传了两个文件,第一个文件是图一,第二个文件是图二,我不想用OTU的ID号做分析相,想做门水平的细菌,第二个表是抗性基因的数据,想观察抗性基因和门水平菌的共现性网络...
...出入,不知道如何择选的,因为genecode上面没有单独mRNA这个数据包 也根据视频下载的是核染色体的基因注释,这就使得非编码和编码的都包含了,这个从我打开文本也可以看出是这样的。 然后我想获取编码RNA,我之前没仔细...
...ge sample_files 1000 2 1 1 0 30 all_sample_sv.vcf 但如果遇到只有一个样品时会生成空的vcf。这时候可以改成如下命令运行: ls *.max.vcf >sample_files && /share/work/biosoft/SURVIVOR/SURVIVOR/Debug/SURVIVOR merge sample_files 1000 1 1 1 0 30 all_sample_sv.vcf ...
...一步,生成bowtie.sam和fin.sam文件的时候,可不可以分别做2个,就是因为测序批次问题,可不可以分开2次进行去宿主生成.sam文件,然后前后2次所有的文件放在一个文件夹里,一起进行下一步? 还有,组装的时候,可不可以单样...
...练好细菌V4区的分类器,可在QIIME2官网下载 https://docs.qiime2.org/2022.8/data-resources/ 方法注释在训练分类器之前,我们要弄清楚三点:1.选择合适的数据库;2.扩增引物;3测序序列长度分布(此步骤可选择使用)。 在本...
...完全一样,再转化成txt制表符文件格式后输入,选择第二个选项(由biom格式转化来的文件),结果报错。把测序公司提供的biom格式文件输入,选择第三个选项(biom HDF5格式,还是报错)。因此我推测是我的原始数据的问题,所...
...input filter---method--row minicc中输入的数字的含义是什么,这个数字的大小根据什么确定呢? 在Method menu进行相关性、相似性以及距离计算方法的选择。比如我只想保留pearson,spearman系数>0.8的边构建网络,如何进行设置呢,看教程...
...以为是其他包中的颜色无法识别, 后来使用了默认的四个颜色,也用了ggplot2包自带的色版,都不可以,应该是代码没输入正确,请老师帮忙看看,谢谢!
...没有BioSequence Structure Drawers——Amazing Optional Gene Viewer 这2个选项,如图: 请问这是什么原因呢?我的TBtools软件是在基因家族分析课程里下载的。
... fileEncoding = "", encoding = "unknown", text, skipNul = FALSE) 每个参数都有自己的意义,其中比较常用的有header,sep等. file是我们读入的文件名称;header,设置为T或F,是否把第一行定义为header;sep是设置文件内的分隔符。我们看个例子...
...1988年,牛津大学的进化生物学家Robert May根据观察得出一个经验性的描述:陆地上的生物体型越小,生物多样性就越大。在此基础上他认为人类已经发现大多数体型较大的动物,比如哺乳动物、爬行动物、鸟类等,可以认为已知...
1,批量下载 准备一个文本文件复制url cat url.txt | xargs -n 1 -t wget 2,删除过多相同特征的文件,rm命令有参数限制,超过了就会报错,这个时候可以用xargs find ./ -type f -name "*.log" -print0 | xargs -0 rm -f 3,删除空文件 find ./ -name "...