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文章 Nature:2019年度最佳科学图片top10,总有一张震撼到你!

...有了这张图片。 8,最佳拍档 这是一张伪彩色图像,显示了美国T-38“鹰爪”超音速飞机发射出的冲击波。这是一张“有声音"的图,展示了空气压力的快速变化导致人们听到的音爆声,有助于科学家们设计出更安静的超音速飞...

问题 WGCNA安装以及运行问题?

...? 2.运行代码“gsg = goodSamplesGenes(datExpr0, verbose = 3)”,显示“Error in gsg = goodSamplesGenes(datExpr0, verbose = 3) :could not find function "goodSamplesGenes” 运行代码“gsg$allOK”,显示“Error : object 'gsg' not found”.

文章 cytoscape-cytoHubba插件的安装与使用

...对整个网络分析的话,此项可以忽略) 5、点击左下方:显示最短的路径;显示出hub gene连接到的第一个节点;显示出最长的子网络) 6、右边的列表就显示关键基因的排名:颜色越深,证明分数越高,越显著

文章 鉴定domain同时分析蛋白互作

...相关ID或者氨基酸序列(见下图A),而提交之后跳转页面显示出对应的结构域信息,同时还展示了互作关系Interactions。其蛋白互作信息是基于STRING数据库获取,通过输入蛋白,能够判断哪些基因编码的蛋白与该蛋白存在紧密联系...

问题 bio-linux中用hmmsearch遇到问题

用NB-ARC.hmm搜索拟南芥的蛋白质保守结构域时,运行显示fatal exception(source file fwdback.c, line 459);foeward score is NaN。再次运行显示segmentation fault

文章 Excel快速画出美观饼图

...绘制饼图只需简单的两列数据即可,一列标明类别,一列显示该类别数据量,以此数据绘制出饼图将展示出各类型所占数据比例情况,例如本次以下图两列数据进行绘图: 绘图1、Excel工具栏“插入”可以在表格中插入多种图...

问题 bio-linux中用hmmsearch遇到问题

用NB-ARC.hmm搜索拟南芥的蛋白质保守结构域时,运行显示fatal exception(source file fwdback.c, line 459);foeward score is NaN。再次运行显示segmentation fault。麻烦老师看看是什么问题,非常感谢!!

文章 GEO、TCGA多数据库联合挖掘胰腺导管腺癌预后关键基因

...alue<0.05,见下图)。 文章进一步开展ROC曲线分析,结果显示筛选到的10个基因AUC值大于0.5(见下图)。 此外,为探究关键模块中的差异基因是否涉及癌症相关功能,利用DAVID对yellow模块中的所有基因进行了富集分析,结果如下...

文章 基因家族分析如何能发到cells?!

...截取TaPHT1s基因2kb上游区域进行顺式作用元件分析,结果显示TaPHT1s具有参与Pi和AM反应的潜在调控元件。 5. AM真菌降低了营养阶段小麦的Pi含量和生物量 接种两种AM真菌F. mosseae和G. versiforme后六周,根部真菌结构的染色表明,接...

文章 Mapchart绘制基因染色体位置图

...分之间以空格分开即可(不拘多少个空格,但是为了数据显示美观,最好保持一致),每一个chrom下的基因都是属于该对应的染色体上的基因; 2、基因之间有先后顺序,严格按照在染色体上的先后顺序排列; 3、各行之间可以...

文章 R语言逻辑运算符与算术运算符

1.算术运算符 下表显示了R语言支持的算术运算符。运算符对向量的每个元素进行操作。 加法(+), 相加两个向量。示例代码:v <- c( 2,5.5,6); t <- c(8, 3, 4); print(v+t); 执行上面示例代码,得到以下结果 -[1] 10.0 8.5 10.0 减法(-), ...

文章 R语言基础入门—运算符!

...符逻辑运算符赋值运算符其他运算符 算数运算符 下表显示了R语言支持的算术运算符。操作符对向量的每个元素起作用。 +两个向量相加v <- c( 2,5.5,6)t <- c(8, 3, 4)print(v+t)#它产生以下结果 10.0  8.5  10.0-两个向量相减v...

文章 TCGA数据库挖掘-肾细胞癌相关biomiarker筛选案例解析

...性更明显(见下图B)。 其中Brown模块内GS与MM分析结果显示,该模块内的基因与pathologic_stage显著相关(见下图),并基于MM高于0.8,GS高于0.2 筛选出了39个基因进行后期分析。 3.重要模块基因功能富集 针对Brown模块内的基因...

文章 R语言中实现T检验及可视化

...   Woman  0.0154 0.015 0.015    *        T-test 绘图显示 install.packages("ggpubr")library(ggpubr)p <- ggboxplot(mydata, x="group", y = "weight", color = "group", palette = "jco", add = "jitter",  short.panel.labs = FALSE)# 添加p值p + stat_compare...

问题 老师,您好,我按照课程执行重测序里面的变异结果统计与绘图,其中indel可以正常执行,但是snp运算没有结果,请问老师是什么原因呢?

...dir/vcf_start.pl -vcf snp.unknown_multianno.vcf -type snp时总是出错,显示Use of uninitialzed value in division (/) at /work/scripts/vcf_stat.pl line 313.还有Illegal division by zero at /work/scripts/vcf_stat.pl line 312.运算没有结果,请问老师是什么原因呢?