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问题 基于全基因组信息进行AAI和ANI分析

老师们好。我想做一下基于基因组来计算DNA-DNA hybridization (DDH), Average Nucleotide Identity (ANI), Average Amino Acid Identity (AAI)分析,但是要使用的俩个软件(Jspecies和CompareM)不太会弄,有没有哪位老师做过,谢谢!Q:1870871361

问题 老师,您好,不能用GFF文件提取exon位置信息文件,结果文件是空的

我的GFF文件是这样的,NCBI下载的,请问下该怎么处理啊老师?

问题 您好,可以加你一个微信号不,向你请教一些生物信息学的问题,谢谢

问题 老师,motif在输入脚本后一直显示下面图片信息,导不出图片,文件一直是空的

问题 每次拿基因id去gff3文件里做比对找信息(perl),输出空白

问题 老师,下面是报错、染色体信息、gff文件中的染色体和命令行

文章 线上直播生物信息课程(填写问卷有优惠)

生物信息学正在受到越来越广泛的重视,一方面可以大幅节约课题组测序成本,缩短分析时间,加快文章产出速度,另一方面掌握生信技能也是对自身能力的极大提升,无论是继续深造还是职场应聘都有巨大的助力作用。 想...

问题 每次拿基因id去gff3文件里做比对找信息(perl),输出空白

可以搜索出来但是仍然是空白文件

问题 各位老师,请问怎么下载一个物种整个染色体全基因组的序列信息?(不是单个基因的)

问题 在获取染色体的长度信息的时候samtools faidx一直运行不出来,是为什么?

问题 请问nextpolish运行报错,run.cfg文件和报错信息如图,麻烦老师看下,谢谢!

问题 在国家基因组下载的基因组信息是这样,请问下面这一步该怎么修改

代码这个该如何修改

问题 合并提取后的domain序列之后,linux系统中的clustalw不能读出蛋白信息

...件的序列粘贴到一个新建文件中),clustalw不能读出蛋白信息。如下图:第一张图是Sequence Input From Disc输入的WRKY_domain.fa文件,回车后可以出现序列对应的蛋白名称和AA长度;第二张图是Sequence Input From Disc输入的合并后的domain.fa文...

问题 如何修改perl脚本,利用id号抽提gff文件中的位置信息

物种gff文件的信息格式如下:ID号是第二列的 si*G****** perl脚本信息如下: use Getopt::Long; my %opts; use Data::Dumper; GetOptions (\%opts,"in1=s","in2=s","out=s","h");  if (! defined($opts{in1}) ||! defined($opts{in2})||! defined($opts{out}) || defined($opts{h})){ &...

问题 Linux系统中在删除GFF文件ID中不必要信息,如gene:时出现报错