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文章 SNP能转化成CAPS标记?来试试dCAPS吧!

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问题 关于wgcna模块内基因数目的问题

在进行WGCNA分析时,全部分析完之后。 table(moduleColors) 显示模块里面的数目 我的兴趣模块有600来个基因数 之后我在cytoscape那个文本里面,node文本里面,我发现只有400来个。 之后检查了下,cytoscape里面的node数目全都少于table...

文章 Graphpad Prism绘制折线图

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文章 转录组+?分析+?实验=2区文章

...)上的转录组测序文章。 该文章总的来说是转录组测序分析+荧光定量PCR验证+少量的实验,思路清晰,设计简单,值得借鉴! 本文以银杏为实验材料,在取样之前,作者通过显微镜观察,来确认银杏胚珠花粉室形成过程中的各...

文章 R语言绘图之调色

...| WGCNA筛选biomarker | 3分2区蛋白质组学文章 | 基因家族分析 | ceRNA | NCBI中的基因组数据 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程...

文章 ENA数据库查询SRA数据

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文章 R语言中读入数据时指定每一列数据类型

...从而导致第一列变为 "1" ,而非 "01"。这可能会导致后续分析出现问题。 为避免出现这种情况,需要为其指定数据类型,用到参数为colClasses ,colClasses参数使用一个向量,为每一列指定数据类型。如下所示: data <- read.table(f...

问题 getorganelle组装线粒体出现问题

...右的序列,请问怎么设置参数才能 only top reads进行后续分析,而能够使用全部reads进行后续分析

文章 记录一个用AI排除错误banksy

... (ctrl+o to expand) ● 找到了根本原因。让我确认 Matrix 包的版本。 ● Bash(Rscript -e 'packageVersion("Matrix")' 2>/dev/null) ⎿  [1] ‘1.7.6’ ● Bash(Rscript -e 'library(Matrix); getClassDef("zgeMatrix")' 2>&1) ⎿  NULL ● Bash(Rscript -e ' library...

文章 perl程序中shift的用法

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文章 QIIME1格式转换

...table后跟物种注释) 2.转换成biom格式文件:(docker上下QIIME1镜像) biom convert -i mat.txt -o otu_table.from_txt.biom --table-type="OTU table" --process-obs-metadata taxonomy --to-hdf5 3.在运用QIIME1脚本进行分类: 同水平下相对丰度文件: summarize...

问题 https://snp-seek.irri.org/_download.zul从这个网站下全基因组测序文件,进行GWAS分析,下哪几个啊

愁死了,手里有从这个基因库的一些品种,想把这个基因库的全基因组序列下下来,可是知道怎么下

文章 使用hisat2软件将测序数据比对到基因组

...ort -o rnaseq.bam rnaseq.sam 有比对的bam文件,就可以进行后续分析了。 此外,我们在网易云课堂上有各种教学视,有兴趣可以了解一下: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:...

文章 【Linux】查看文件中的某几行(中间几行)

...。 3、grep命令 grep -C 5 Error filename  # 显示file文件中匹配Error字符串那行以及上下5行 grep -B 5 Error filename  # 显示Error及前5行 grep -A 5 Error filename  # 显示Error及后5行

问题 老师您好,同样本使用的引物同,课程提供的脚本在去噪这一步以及后续物种注释都只有一个引物。如何对同引物进行统一的物种注释和多样性分析

得到了同样本的sra文件,由于样本同使用的引物序列也一样。想把他们放在一起分析,得到他们的多样性和物种注释