问题 请教老师，用自己的hmm文件，进行了domain的二次搜索，结果如下图所示。结果显示仍然会有很多只是匹配了一部分序列片段。我用这些部分比对上的结果截取序列后，再三大数据库对比发现也存在我想要的domain. 现在的问题是，如果要这些部分的结果截取序列，做进化树就会差异太大。如果不要部分比对上的，又怕少了家族序列。只有一部对比上的，到底如何取舍呢？这样的情况如何处理，有没有相关的标准？谢谢

问题 老师您好，我已经和hmmsearch之后，想提取一定Evalue值的基因家族的蛋白保守序列，请问需要用的perl脚本domain_xulie.pl的文件在哪里能下载呢？感谢！

问题 生信分析为什么要学习linux系统，好多不是直接通过windows系统的R语言就能解决吗？哪些分析时需要用linux，为什么不用windows，可以举例下吗？

问题 我想问下我在可视化的时候，部分窗口（点）展示不完全（只展示半个点）我应该怎么调整？点的大小调整过了 还是不行。需要用哪个参数进行调整呀？谢谢各位大佬！

文章 开年第一篇!2区基因家族分析文章赏析！苦荞MAPK家族分析-2022年2月3日，最新文献！

...反应的调节；在植物的发育、激素调节和非生物胁迫反应中发挥着重要作用。目前为止，在苦荞中尚未有关于丝裂原活化蛋白激酶（MAPKs）系统全面研究，故本文在全基因组层面对苦荞中MAPKs基因进行鉴定、系统发育、染色体定...

文章 混合线性模型中BLUE值 VS BLUP值

混合线性模型中BLUE值 VS BLUP值 最佳线性无偏预测(best linear unbiased prediction， 简称BLUP)，又音译为“布拉普”[1]，是统计学上用于线性混合模型对随机效应进行预测的一种方法。最佳线性无偏预测由C.R. Henderson提出。随机效应的最...

问题 老师我用这个脚本文件提取基因的注释信息，为什么只能提取出CDS的位置信息呢，其他如外显子位置信息提取不出来呢？如下图，请问老师这是什么一个原因呢？

问题 向各位老师请教下关于遗传图谱的问题，我的实验群体为半同胞家系，需要进行遗传图谱绘制与QTL分析，请问下该如何绘制遗传图谱，用什么软件？向各位老师请教！万分感谢！

问题 请教一下大家 用mega做进化树是要把序列两端给剪切对齐吗 序列之间的空白需要剪切吗 我的序列有一些比较短 需要舍去吗 我做进化树一直出现下面这个问题

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问题 老师您好，我有个问题想请教您，就是以您看的文献来说，您觉得有转录因子调控CDPK激酶的文献，就是说转录因子可以和CDPK激酶的启动子结合的例子吗？因为我用某个CDPK酵母双杂交筛到了一个转录因子，现在不确定到底是这个转录因子结合了CDPK的启动子，还是这个CDPK激酶对这个转录因子磷酸化，对于它们的上下游关系我还不是太明白，是不是用CDPK筛到的转录因子就说明了什么关系呢它们之间

文章 rocks7 集群安装笔记

...并且官方还搭建了roll-server。可是鉴于网络原因，我们使用官方的roll-server会有慢卡断等问题，所以还是本地搭建服务器为佳。 1、镜像下载 我们首先要去rocks官网获取roll镜像： http://www.rocksclusters.org/downloads/2017-12-01-download-rocks...

问题 用校正过的gb文件进行CPGAVAS2注释出现报错

我通过GeSeq进行注释后，用Geneious进行检查并手动纠错后，删掉了info和annotation行后，将这个库重新用CPGAVAS2进行注释，就会报下面的错说“no hit found”，请问是什么原因呢？ 我的部分注释如下：      gene            comp...

文章 以OKR驱动企业项目化管理变革

OKR目标管理对公司的意义 OKR大概在2013年传入中国，开始主要是一些有硅谷背景的初创企业在推行，现在OKR逐步受到IT、互联网、高科技企业的追捧，开始变得流行起来，国内知名的互联网公司豌豆荚、知乎都成功的在企业内部...

文章 人类miRNA-mRNA 与 miRNA-lncRNA 靶向数据库总结

The experimentally verified miRNA-mRNA pairs were downloaded from starBase v3.0 (18), DIANA-Tarbase v8 (19), miRTarbase (v7.0) (20) and miRSponge (21) databases, while the experimentally validated miRNA-lncRNA pairs were extracted from starBase v3.0 (18), LncACTdb2.0 (22), DIANA-LncBase Experimental...