...cf格式 表型格式 EVM0022117.recode.vcf 脚本如下： library(argparse) # 导入包# Add command line argumentsparser <- ArgumentParser(description='haplotype analysis plot')parser$add_argument( "-i", "--workdir", type="character",default=getwd(), ...
按照RNA-seq课程教的方面，将自己的课程数据换成自己的数据，得不到结果。中间不知道哪里错了，麻烦老师给个解决的办法，谢谢
这个代码有两个主模块，DataFetcher and CountSummarizer 前者使用cr调用，用于从根据参考列提取数据， 比如有一个文件想根据这里的某一列提取行，参考数据如下 使用代码，得到结果 后者使用ex调用，功能复杂一点，用法比较...
...，是按照第一列内容进行展示的，如下图：A green;red;blueB yellow;greenC red;blue;grey;pink;blankD green;grey现在想将文件按照第二列数据进行整理查看，如下图：blank Cblue A Cgreen A B Dgrey C Dpink Cred A Cyellow ...
piranha输出的bed文件会把每一个bin给出一个p值，大部分bin的p值都小于0.01，要怎么筛选出显著的peak去找motif？如果一个peak跨两个bin，给出的p值是bin的而不是peak的，这种要怎么处理？
我运行下面的你们给的代码 RepeatMasker -e rmblast -gff -xsmall -html -norna -source -no_is -pa ${threads} -s -lib allRepeats.final.lib contig.fa# -e rmblast 指定搜索引擎为rmblast，还可以选择crossmatch、abblast或者hmmer# -species "Danio rerio" 指定物种为斑马鱼...
...个表格统计的差异基因数量不一致，如下图所示： A_vs_B.GO_ann.stat.xls文件： A_vs_B_GO_enrich.xls 同是extracellular region，差异基因的数量却不相同，这是由于两个表统计的方法不太一致： A_vs_B_GO_enrich.xls文件统计时，会在A_vs_B.GO.l...
染色体的ID在图中无法展示全，我加了radius*=4000p的参数就变成第二个图，但是整体的字体缩小，看不清染色体的ID，无法一目了然，尤其是染色质刻度上。我在Circos官网上没找到，所以想问一下改哪个参数保证是第一张图的字...
GitHub 这几年国内普通用户越来越难以访问，github 作为全球最大的开源平台，里面有用的内容很多，不管是对专业用户还是普通用户，无法访问都是很严重的问题，使用频率高的直接拉到页面最下方使用自动更新 IP 方法，替换...
在官方示例中，进行模块保守性检测，作者用了3600个雄鼠基因和雌鼠的3600个基因。我有两类样本，每一类样本都进行了WGCNA分析，若这两类样本基因数目不一致，还能进行模块保守型分析么？
...任务运行怎么出错？命令是nohup ParaFly -c work285.sh -CPU 8 > work285.sh-4.o& ， 而不用并行命令 直接运行nohup sh work285.sh >work285-3.sh.o& 这个命令就不报错，这是怎么回事？ sh: -I: command not found warning, cmd: -I $workdir/3.map/re...
有人使用Excel时会不小心在单元格最后加个换行符，如果比较少，可以直接删掉，但是如果较多，一个个删就会很费劲。 这里有一种快速解决的方法。 1、选择要替换的单元格区域2、按CTRL+H快捷键，弹出查找与替换对话框3、...
...到最新的参考序列 qiime deblur denoise-other \ --i-demultiplexed-seqs demux-joined-filtered.qza \ --i-reference-seqs $dbdir/qiime2/unite_ver9_99_25.07.2023-Q2-2023.7.qza \ --p-trim-length -1 \ --p-sample-stats \ --p-jobs-to-start 10 \ --p-min-reads 1 \ ...
...量基因表达数据的公共仓库。目前，GEO存储了大约10亿单个基因表达的数据，来自于100多种生物，内容广泛涉及到各种生物学问题。这些大容量的数据可以使用用户友好的以Web为基础的工具进行有效的挖掘，检索和可视化表达。G...
...不同的参考基因组进行分析的，最终选择了差异较大的17个基因（不同基因组均有涉及的）进行验证，那GO分析的时候是利用差异基因进行分析，如果采用不同的参考基因组，GO的结果应该是受到影响的吧?但是不同基因组注释的...