您好，我看有个帖子下有您关于CGView COG文件注释的问题，正好我也在弄这个，想请问一下具体是怎么操作的呢，希望您能回答一下，谢谢
经过NGS十余载的商业运营，要想找个生物实验室完全没听说过测序的也是很难了，为了各种实验目的，自己去测点数据已经是稀松平常的事情了。但是马上要到来的公共数据挖掘时代，您是否有足够的认识？ 如果您还没有感知...
...opgo里面绘制node图的函数是showSigOfNodes()，其中提供的第二个参数不能有0，否则会报错： showSigOfNodes(sampleGOdata, score(resultKS.elim), firstSigNodes = 10, useInfo = "all") Error in if ((n <- as.integer(n[1L])) > 0) { : missing value where TRU...
已有资料： 1，基因家族课程中的get_fa_by_id的那个脚本，2，多个物种的ID 3，几个物种的CDS库 现在我有上百个ID文件，是按照分类划分好的，想按照TXT文档名字循环运行这个脚本，从CDS总库中提取出每个文件ID对应的CDS序列， 请...
目前我的数据有39条contigs，3543 个protein-coding genes, 10 rRNA genes, 65 tRNA genes等等，我想把这些数据上传到Genome数据库，需要准备什么未见啊，恳求指点
...AT.gff文件提取蛋白序列，做的水稻，此外，我怀疑只有一个转录本时，在gene DI后加-00，多于1个转录本时从-01开始编号，在拟南芥中，按照您的教程，只能提取到多于1个转一个录本的蛋白序列，只有一个转录本的不能提取啊，因...
关于Cytoscape绘图，一个酶对应的几个基因之间的关系图怎么画呢？现在只画了基因与转录因子之间的网络图，想添加同源基因之间的联系。先跪谢果各位路过的热心大佬们了！ 可加qq（1114863741）或者微信（spring_0615）讨论。
请问：现在我取了花蕾的六个发育时期，两个生物学重复，现在怎么定义性状数据？
支持的20个模式物种列表如下： PackageMaintainerTitleIndexorg.Hs.eg.dbBioconductor Package MaintainerGenome wide annotation for Human3org.Mm.eg.dbBioconductor Package MaintainerGenome wide annotation for Mouse5org.Rn.eg.dbBioconductor Package MaintainerGenome wide annotation for Rat19o...
老师您好，请问启动子序列中，是A处的碱基是-1还是B处的碱基是-1。A和B谁是靠近ATG的？
...给他了。 实际上，我们已经向我们怀疑是审稿人C的四五个人邮寄了**， 3、您建议我们将原稿缩短五页，我们可以通过更改边距、缩小字体来实现。 4、审稿人B建议我引用16篇文献，而这16篇文献来自不同领域，但是跟我的研...
awk中gsub可以进行匹配替换： gsub(A,B)在$0中利用B替换A gsub(A,B,C)在指定的C中用B替换A 以数据test为例（TAB分隔）： ABCD abcd HJIKEL AbDE SGWA 全部替换 A字符换成DA字符 awk -F "\t" '{gsub("A","DA");print $0}' test 结果...
... SINE 那行代表的是什么意思，我看好像不是 SINE 下面四个次级分类的总数，如果我要统计 SINE 在基因组中的数目、长度和占比的时候，是只需要SINE 那行的信息还是需要统计SINE 那行及下面四行的信息总和（比如数目的话就是 757...
...电脑画图出现下面的情况，用同样的数据和代码在其他3个电脑上没有问题，请教一下，我电脑哪里出问题了？dat<-read.table("",header=T,row.names=1)dat<-as.matrix(dat)head(dat) barplot(dat,col=colors()[],beside=T, space=c(0,1),ylim=c(0,20),ylab="DEGs Numbe...
...6h取样进行转录组测序，实验设置了3组生物学重复，共15个样品。我们发现，可能是取样时间间隔过短的原因，生物学重复（组内）的相关系数（0.7左右）低于样品间（组间）相关系数（0.8-0.9），我想知道这样数据还能用吗？