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问题 用什么软件可以直接画出染色体Ks值的箱线图?数据格式如下

问题 有没有用过aspera软件上传数据的呢,我在写命令的时候总是出错

问题 您好,我手上有一组转录因子的数据,但不知道分析的具体步骤是啥

问题 老师,镜像版本合适,数据我是从Demo转的,但是还是不行,我用reference也试了不行

问题 同一目下边的俩物种,基因组测序数据mapping率只有20%,这合理吗?

问题 GWAS课程镜像中如何用gapit做单年的表型数据的GWAS关联

问题 可以利用重测序的结果做表型预测模型吗?(模型构建数据仅基于重测序结果做)

问题 老师,为什么我把data数据链接过来的时候链接不过来,会出现这样页面?

文章 cBioportal使用教程

cBioportal这个网站,促进多维度癌症基因集数据的探索,可以允许跨gene,样本和数据类型的可视化分析。用户可以可视化一个癌症研究中多样本间基因改变的模式,并比较点多癌症研究中gene改变频率,或者在一个个体肿瘤样本中...

问题 在TCGA基因表达差异分析这门课的最开始,下载数据就报错

这是安装完TCGAbiolink以后加载过程中报错的。

问题 老师,HGMD链接失效了,可以再分享一下HGMD数据库的信息吗?

目前需要批量注释位点的信息,需要本地化的HGMD信息,希望老师可以提供一下帮助。

文章 使用peer根据表达量数据推断隐藏因子

...变量,分析中隐藏因子的引入主要是用来排除影响表达量数据的一些混淆因素,例如样本的采样环境、样本批次、其他位置因素等,这些因素视作分析中的无关因素(即一些无法测量的,但是会影响基因表达的因素),需要进行预...

问题 老师 这是你们给的测试数据,我在注释的第一步就遇到下面的问题,需要怎么处理, 还有一个问题就是我自己组装我的数据的时候 遇到的问题就是你问我用的是什么测序仪,我也回复啦一个星期啦,我的问题是不能解决啦吗,就是这一个问题,已经一个多月啦还是老样子,

还有就是你们给的测试数据按照你们给的代码 什么都是一模一样的  代码搞到服务器上去 跑着就有问题  这是怎么回事  

问题 老师,我想请问一下下面的这个文件里面的数据可以直接用吗?这是下载自对应植物基因组数据库的,就是一些基因在胁迫处理和各个组织器官中的表达量。其次我想问一下有什么方法可以知道这个文件来自那篇文献,这样我觉得有助于理解。

DM_RH_RNA-Seq_FPKM_expression_matrix_for_DM_v4.03_13dec2013_desc.txt.zip

问题 猪单细胞数据差异基因KEGG富集分析

根据老师提供的单细胞转录组课程、有参转录组课程和代码,对KEGG富集分析的代码进修修改,执行此代码Rscript $scripts/enrichKEGG_pip.r --gene.list FindMarkers.deg.Enterocyte.AvsB.tsv -o KEGG -n deg.Enterocyte.AvsB --pvalueCutoff 0.05 --ann.db org.Ss.eg.db --orga...