cBioportal这个网站,促进多维度癌症基因集数据的探索,可以允许跨gene,样本和数据类型的可视化分析。用户可以可视化一个癌症研究中多样本间基因改变的模式,并比较点多癌症研究中gene改变频率,或者在一个个体肿瘤样本中...
这是安装完TCGAbiolink以后加载过程中报错的。
目前需要批量注释位点的信息,需要本地化的HGMD信息,希望老师可以提供一下帮助。
...变量,分析中隐藏因子的引入主要是用来排除影响表达量数据的一些混淆因素,例如样本的采样环境、样本批次、其他位置因素等,这些因素视作分析中的无关因素(即一些无法测量的,但是会影响基因表达的因素),需要进行预...
还有就是你们给的测试数据按照你们给的代码 什么都是一模一样的 代码搞到服务器上去 跑着就有问题 这是怎么回事
DM_RH_RNA-Seq_FPKM_expression_matrix_for_DM_v4.03_13dec2013_desc.txt.zip
根据老师提供的单细胞转录组课程、有参转录组课程和代码,对KEGG富集分析的代码进修修改,执行此代码Rscript $scripts/enrichKEGG_pip.r --gene.list FindMarkers.deg.Enterocyte.AvsB.tsv -o KEGG -n deg.Enterocyte.AvsB --pvalueCutoff 0.05 --ann.db org.Ss.eg.db --orga...