根据p值获取关联区域中,为什么要用如下语句以合并P值 cat pvalue.bed region.bed |sort -k1,1 -k2,2n >all.region.bed 合并P值在获取关联区域的作用是什么,可否像之前录像讲的那样不用这个语句吗?
...查看特定位置的比对情况: 命令行如下: samtools tview -p B05:53425172 accepted_hits.bam Bju.genome.fa DNA重测序比对结果: 结果说明: “.” 比对到正链;“,” 表示比对到负链;“<”或“>” 表示reference skip RNA-seq当中内含...
...我在cytoscape中使用conet插件绘制互作网络图,我上传了两个文件,第一个文件是图一,第二个文件是图二,我不想用OTU的ID号做分析相,想做门水平的细菌,第二个表是抗性基因的数据,想观察抗性基因和门水平菌的共现性网络...
...最后的evalue值根据实际情况可调,注意脚本提取的是第一个domain,如要提取其他domain,请修改脚本27行$a[9]==1为第一个,$a[9]==2为第二个,依次类推perl script/domain_xulie.pl WRKY_hmm_out.txt Arabidopsis_thaliana.TAIR10.pep.all.fa WRKY_domain.fa 1.2e-28####...
今天为大家介绍一个有名的搜索蛋白互作网络的数据库:STRING。教大家如何制作一个蛋白互作网络 STRING数据库介绍: nString数据库是一个搜索已知蛋白质之间和预测蛋白质之间相互作用的数据库,该数据库可应用于2031个物种,...
...白质的功能由包含的多个domain共同决定,研究domain, 可以更好的研究蛋白质功能,而具有相同结构域的基因往往形成一个基因家族。 基因家族是来源于同一个祖先,由一个基因通过基因重复而产生两个或更多的拷贝而构成的一...
用三代数据sv结果对二代数据进行基因分型,合并两个结果时出现问题,bcftools merge合并的结果,缺失率太大,导致用plink进行pca分析时因缺失率太高无法进行,survivor merge 1000 1 1 0 0 50,合并后样本名减少,并且计算Fst为几个固定...
...呢?很多人还只停留在定量水平,蛋白质表达量肯定是一个值得考虑探究的因素,但是蛋白质的空间结构与其功能更是相关;蛋白质结构预测你会吗?今天给你分享一款很实用的蛋白结构、功能和变异预测分析的在线工具,感兴...
我这里有204个基因,用mcscan X做出来的物种内共线性只有四对,可以调节某个数值来增加对数吗?我反复观看了课程视频只看到了在blast比对那里有调节参数的地方,是需要修改默认参数e-10那里吗?要是修改e值是调大还是调小呢...
...也没有报错.o文件也显示成功完成,前边map文件也显示28个染色体,不知道那里出了问题,请老师指教,谢谢!
ERRO[0000] Error refreshing container af05fafe31f6bfb00c2599255c47e35813ecf5af9bbe6760ae8a4abffd343627: error acquiring lock 1 for container af05fafe31f6bfb00c2599255c47e35813ecf5af9bbe6760ae8a4abffd343627: file exists ERRO[0000] Error refreshing container b4620633d99f156bb59eb327a918220d67145f819...
...上面的解决方案有很多资料,在查阅相关资料时,发现一个最优解。完全不需要启动时修改 grub 配置信息。发现原因是ISO映像文件的驱动器卷标太长,与FAT32驱动器不兼容所致。具体解释如下:ISO映像文件中的驱动器卷标很长,...
运算符是一个符号,通知编译器执行特定的数学或逻辑操作。R语言具有丰富的内置运算符,共以下5种类型的运算符。 运算符的类型 R语言中拥有如下几种运算符类型: 算术运算符关系运算符逻辑运算符赋值运算符其他运算符...
老师,问答页面不能显示图片,我现在有个问题:gff文件是这样的:,运行命令perl script/mRNAid_to_geneid.pl Arabidopsis_thaliana.TAIR10.41.gff3 mRNA2geneID.txt得到的文件是这样的, ,请问怎么解决啊?
...做BSR分析,vcf文件中包含了亲本和混池的snp信息,但是每个样本各有3个生物学重复,请问这种情况下我该怎么合并这三个重复的数据呢?因为不知道怎么处理我目前是只用了其中一组数据来进行的定位。