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问题 求蛋白家族的进化聚类分析详细方案

...不同物种的分泌蛋白超家族进化分析,因为序列量大,该怎么比对和构建进化树呢? 急等各位大侠解答,请多赐教!

文章 GFF文件格式不标准,第三列只有mRNA处理方法

gff文件第三列一般有gene,mRNA,CDS,exon等等信息,但是有时候没有gene信息,只有mRNA信息,这种情况一般是一个基因只注释了一个转录本的基因组,这个时候我们可以批量的处理一下,添加上gene行信息,也就是mRNA信息直接用于...

问题 三代纠错软件lordec安装问题

我在安装lordec时报如下错误: Install the project... -- Install configuration: "" -- Installing: /usr/local/HDF_Group/HDF5/1.8.18/examples CMake Error at cmake_install.cmake:41 (file):   file INSTALL cannot make directory   "/usr/local/HDF_Group/HDF5/1.8.18/examples": No such file ...

文章 遗传图谱构建基础知识

...记在染色体上的相对位置或线性排列图。 理论基础 在细胞减数分裂时,非同源染色体上的基因相互独立、自由组合,同源染色体上的基因产生交换与重组,交换的频率随基因间距离的增加而增大。位于同一染色体上的基因在...

文章 植物单细胞分析方法

Cell calling To identify high-quality nuclei (a term used interchangeably with “barcodes”) using the filtered set of alignments, we implemented heuristic cutoffs for genomic context and sequencing depth indicative of high-quality nuclei. Specifically, we fit a smoothed spline to the log10...

问题 TBtools安装包在基因家族分析课程的软件里没有,下载链接也没有,请问这样的课程是不是还有改进的地方

问题 老师你好,问一下如果所做物种只有基因组数据,没有转录本,CDS等文件,该用什么软件分析得到别的数据

问题 您好,我做全长转录组,我安装的软件isoseq3没有polish这个功能?请问我要安装isoseq3的哪个版本?

问题 老师,有参转录组这个课程里面输入命令总是出现这情况,如下图,是不是转录组的镜像没安装这些软件

问题 老师您好 我用tassel软件跑MLM模型时,按照程序跑了好几遍一直报错,检查了数据没有问题,期待老师解答

文章 iTOL修改进化树的标签基因ID名称

...示进化树: 只需要添加一标签的注释文件即可,文件格式如下: LABELS#use this template to change the leaf labels, or define/change the internal node names (displayed in mouseover popups)#lines starting with a hash are comments and ignored during parsing#==================...

问题 老师,我在输出pdf格式热图的时候,有时导不出热图,并且plot处的热图也不见了,重启Rsudio才可以再次显示,这个是为什么呢。麻烦老师。

问题 你好,请问在biolinux里面运行meme搜索蛋白的motif,nbs_motif文件夹里面只有txt格式的文件,没有xml以及其他文件,这是什么原因呢

文章 SRA Toolkit 工具首次使用提示“This sra toolkit installation has not been configured”

...据。 在首次使用该工具包中的fasterq-dump将srr转换成fastq格式的文件时,出现了如下提示信息: 这提示需要进行配置。可以使用vdb-config –interactive通过互动模式来选择相应的选项,使用vdb-config -h查看各个选项。可以看使用说...

问题 测序公司发来的是组装好的测序结果,其中里面有全基因组的序列(fa格式),这用组数据可否进行“基因组重测序分析”课程中讲的snp,indel,sv等分析呢?

测序公司发来的是组装好的测序结果,其中里面有全基因组的序列(fa格式),这用组数据可否进行“基因组重测序分析”课程中讲的snp,indel,sv等分析呢?